计算化学公社

标题: 求助:Multiwfn做能量分解总能量与Gaussian给出的能量有差异 [打印本页]

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陌上花开小伟    时间: 2019-4-17 22:34
标题: 求助:Multiwfn做能量分解总能量与Gaussian给出的能量有差异
各位老师:        我在用Multiwfn做能量分解时发现其给出的总能量和我用高斯算出的相互作用能差别较大,想向老师们请教原因。
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这个计算一个氨基酸和一个阴离子的相互作用,我是讲高斯优化后的输出文件导进Multiwfn里面做能量分解。
高斯计算关键词是 b3lyp/6-311+g(d,p) em=gd3 scrf=(smd,solvent=water) 考虑了色散校正和在隐式模型下计算。
高斯相互作用能是通过氨基酸-阴离子单点能-氨基酸单点能-离子单点能计算。 (, 下载次数 Times of downloads: 44)
我分析是因为一个是用Amber力场,一个是用DFT计算,而且精度不高,所以才会造成差异。

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sobereva    时间: 2019-4-17 23:40
本来Multiwfn基于分子力场的能量分解就没法严格考虑溶剂效应,光从这点上就能造成显著的能量差异,介电常数大的水环境会显著屏蔽静电相互作用。要比较应当比较真空的
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陌上花开小伟    时间: 2019-4-18 10:13
懂了,谢谢老师解答
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liuyjhx    时间: 2019-5-4 13:23
sobereva 发表于 2019-4-17 23:40
本来Multiwfn基于分子力场的能量分解就没法严格考虑溶剂效应,光从这点上就能造成显著的能量差异,介电常数 ...

老师请问我试算一个有机小分子和苯之间有没有弱的作用力,我是不是应该考虑溶剂模式?但是这个我没有实验依据不知道应该选什么溶剂
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sobereva    时间: 2019-5-4 17:19
liuyjhx 发表于 2019-5-4 13:23
老师请问我试算一个有机小分子和苯之间有没有弱的作用力,我是不是应该考虑溶剂模式?但是这个我没有实验 ...

如果不是考察溶剂下的情况就甭管溶剂
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liuyjhx    时间: 2019-5-4 19:58
sobereva 发表于 2019-5-4 17:19
如果不是考察溶剂下的情况就甭管溶剂

好谢谢
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陌上花开小伟    时间: 2019-5-27 09:11
sobereva 发表于 2019-4-17 23:40
本来Multiwfn基于分子力场的能量分解就没法严格考虑溶剂效应,光从这点上就能造成显著的能量差异,介电常数 ...

还想请问老师,如果用SAPT做能量分解的话,它可以考虑溶剂效应吗?
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sobereva    时间: 2019-5-27 11:31
陌上花开小伟 发表于 2019-5-27 09:11
还想请问老师,如果用SAPT做能量分解的话,它可以考虑溶剂效应吗?

不能。你只能气相下计算,然后用常规方式计算一下溶剂和气相下结合能之差,将之作为讨论结合作用时的单独的一项考虑




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