计算化学公社

标题: 请问一下大家我这个gro文件到底有什么问题啊,grompp一直报错 [打印本页]

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yyy1996    时间: 2019-4-18 09:27
标题: 请问一下大家我这个gro文件到底有什么问题啊,grompp一直报错
something is wrong in the coordinate formatting of file system_soltest.gro. Note that gro is fixed format (see the manual).[attach]18592[/attach]

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sobereva    时间: 2019-4-18 17:24
格式不规矩。gro是固定格式,诸如列错位了之类都导致没法读取
把gro载入VMD,在保存成gro文件,就可以用gmx的工具处理了

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、加快下载速度。已经把你的违规超标的附件删了,请以后注意
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yyy1996    时间: 2019-4-18 21:21
sobereva 发表于 2019-4-18 17:24
格式不规矩。gro是固定格式,诸如列错位了之类都导致没法读取
把gro载入VMD,在保存成gro文件,就可以用gm ...

好的 ,谢谢sob老师的回复。  我的不正规操作给您带来了麻烦,真的十分抱歉。我以后一定十分注意!
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Sasuke    时间: 2020-10-10 15:18
sobereva 发表于 2019-4-18 17:24
格式不规矩。gro是固定格式,诸如列错位了之类都导致没法读取
把gro载入VMD,在保存成gro文件,就可以用gm ...

那请问下我用VMD可以载入gro文件 但是保存时候没有gro文件类型 是需要另外安装相关插件么?
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sobereva    时间: 2020-10-13 06:44
Sasuke 发表于 2020-10-10 15:18
那请问下我用VMD可以载入gro文件 但是保存时候没有gro文件类型 是需要另外安装相关插件么?

至少1.9.3是有保存成gro的选项的




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