sobereva 发表于 2019-4-18 17:30
力场有问题的可能性很大
复合结构跑起来出问题就把体系尽可能简化,并用最简单的关键词跑,然后逐渐加上其 ...
yyy1996 发表于 2019-4-18 21:24
谢谢老师的悉心解答。我用的都是amber99sb力场来处理的。这个力场对蛋白适用,但是不确定铁酸钴晶体适不 ...
sobereva 发表于 2019-4-19 03:37
amber99sb是给生物分子和部分有机分子用的,不可能用于铁酸钴
你搜搜文献铁酸钴这类都用什么力场
sobereva 发表于 2019-4-19 03:37
amber99sb是给生物分子和部分有机分子用的,不可能用于铁酸钴
你搜搜文献铁酸钴这类都用什么力场
yyy1996 发表于 2019-4-23 11:24
老师我更正了一下。我看有文献模拟的是二氧化钛膜吸附的蛋白用的charmm力场,于是我又把整个体系放在char ...
sobereva 发表于 2019-4-24 03:05
charmm不包含这些无机部分的参数,别人如果用这个模拟了,肯定也是额外补了参数。
怎么处理我前面已经说 ...
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