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标题: Out of range atoms - cannot compute PPPM 帮我看看是哪里错了？ [打印本页]

作者
Author: sakura 时间: 2019-4-20 20:08
标题: Out of range atoms - cannot compute PPPM 帮我看看是哪里错了？
大佬们看一下，哪里出问题了，是构型还是in文件出问题了初试构型是out.gro用命令加水生成的。

作者
Author: sakura 时间: 2019-4-20 20:48
我调小步长报错Bond atoms 224 226 missing on proc 1 at step 53

作者
Author: SherryLiu 时间: 2019-5-15 05:54
本帖最后由 SherryLiu 于 2019-5-15 06:14 编辑

建议输出Lx,y,z，检查以下报错之前输出的Lx,y,z 值是多少，重新设置靠近的box size，再运行计算。以下为我的经验：
http://bbs.keinsci.com/thread-13244-1-1.html

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