计算化学公社

标题: 求助multiwfn如何进行.grd文件的作差 [打印本页]

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Author: 華華 时间: 2019-4-26 11:20
标题: 求助multiwfn如何进行.grd文件的作差
想用DMOL3计算差分电荷密度，之前看老师的帖子说可以在Multiwfn软件中使两个片段的电子密度作差来实现，但是Multiwfn可以导入grd文件，但是我输入的时候，显示只支持cub,不知道是怎么回事呢？刚接触这个软件，期待老师的解答，谢谢！！！

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Author: sobereva 时间: 2019-4-26 12:35
cub文件和cubic格点完全是两码事
目前Multiwfn只支持矩形格点，换句话说，计算时候用的晶胞必须是矩形的。以后也会支持非矩形格子

后记：如今的Multiwfn已经支持非正交格子

作者
Author: 華華 时间: 2019-4-26 15:53

sobereva 发表于 2019-4-26 12:35
cub文件和cubic格点完全是两码事
目前Multiwfn只支持矩形格点，换句话说，计算时候用的晶胞必须是矩形的。 ...

明白了，谢谢sob老师的解答

作者
Author: 華華 时间: 2019-4-26 16:45
那如果是.grd的电子密度的文件作差的话可以用什么软件呢，看到有人说可以用Orign或者自己写小程序，但是由于刚接触这方面的知识，可以详细讲讲怎么操作吗？万分感激

作者
Author: sobereva 时间: 2019-4-27 01:26

華華发表于 2019-4-26 16:45
那如果是.grd的电子密度的文件作差的话可以用什么软件呢，看到有人说可以用Orign或者自己写小程序，但是由 ...

实际上，让Multiwfn支持非正交格子很简单，但是即便支持了，也不支持输出grd文件。

用文本编辑器打开此文件，从第6列开始都是格点数据，复制出来，通过origin或excel对两个文件这部分求差，再粘贴回去即可

作者
Author: 華華 时间: 2019-4-28 12:50

sobereva 发表于 2019-4-27 01:26
实际上，让Multiwfn支持非正交格子很简单，但是即便支持了，也不支持输出grd文件。

用文本编辑器打开 ...

谢谢sob老师的解答了

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Author: 天色将晚 时间: 2022-3-2 15:42
老师，我为什么从origin导出的数据用不了，analysis-total density 后会提示无法提取grd文件，以及Corrupt data or unexpected end of file in grd file

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Author: sobereva 时间: 2022-3-12 06:51

天色将晚发表于 2022-3-2 15:42
老师，我为什么从origin导出的数据用不了，analysis-total density 后会提示无法提取grd文件，以及Corrupt ...

仔细看下文把问题交代清楚
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

作者
Author: sobereva 时间: 2022-3-12 06:53

華華发表于 2019-4-26 16:45
那如果是.grd的电子密度的文件作差的话可以用什么软件呢，看到有人说可以用Orign或者自己写小程序，但是由 ...

对于目前Multiwfn最新版，用Multiwfn载入grd文件，再用主功能13的子功能0导出cub文件，对每个grd文件都这么操作弄成cub文件
之后效仿Multiwfn手册4.13.2节的例子，对cub文件作差即可。下文也有对cub文件求差的例子
使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线
http://sobereva.com/638（http://bbs.keinsci.com/thread-28225-1-1.html）

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