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标题: 优化G-C碱基配合物的顺式构象问题 [打印本页]

作者
Author: 八月的雨季 时间: 2019-4-27 22:14
标题: 优化G-C碱基配合物的顺式构象问题
G-C碱基，优化它的顺式构象，老是会优化会到反式构象。很容易看出的确是反式构象更稳定，但就是要计算顺式构象的结构参数。请教各位大佬有什么手段吗？例如限制性优化？冻结哪些原子最容易收敛？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-4-28 03:43
诸如冻这个二面角。当然，这样是不可能得到极小点结构的，先理解这个前提
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作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2019-4-29 07:37
很奇怪你为什么非得要算顺式构象？是因为用什么实验手段观察到顺式构象了吗？

如果是因为实验上观察到顺式构象，你可能需要考虑溶剂效应了。

作者
Author: 八月的雨季 时间: 2019-5-1 16:09

Daniel_Arndt 发表于 2019-4-29 07:37
很奇怪你为什么非得要算顺式构象？是因为用什么实验手段观察到顺式构象了吗？

如果是因为实验上观察到顺 ...

唉，别人投到了欧洲化学上，审稿人要求验证他们的假说。。。

作者
Author: 八月的雨季 时间: 2019-5-1 16:10

sobereva 发表于 2019-4-28 03:43
诸如冻这个二面角。当然，这样是不可能得到极小点结构的，先理解这个前提

Sob大神，这样优化确实不可能正常收敛，但是确实永远都是顺式啊，感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-2 05:19

八月的雨季发表于 2019-5-1 16:10
Sob大神，这样优化确实不可能正常收敛，但是确实永远都是顺式啊，感谢！

程序肯定能“正常收敛”

作者
Author: 413 时间: 2019-7-26 10:43
请问这篇文章见刊了吗？可以给个链接吗？

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