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标题: 在跑完氯化铵与乙醇胺的反应后，怎么求出它的吉布斯自由能？ [打印本页]

作者
Author: 模拟小菜鸟 时间: 2019-4-29 15:23
标题: 在跑完氯化铵与乙醇胺的反应后，怎么求出它的吉布斯自由能？
请问老师我在跑完氯化铵与乙醇胺的反应后，怎么求出它的吉布斯自由能呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-4-29 15:38
问题不明确
GROMACS根本不支持反应力场，怎么跑的反应？自由能具体指什么自由能？

作者
Author: 模拟小菜鸟 时间: 2019-4-30 08:13
老师您好，我用的是AMBER力场，最后想测一个吉布斯自由能。

作者
Author: 模拟小菜鸟 时间: 2019-5-2 22:54
请问老师，GROMACS不支持反应力场是什么意思啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-3 06:44

模拟小菜鸟发表于 2019-5-2 22:54
请问老师，GROMACS不支持反应力场是什么意思啊？

gromacs里支持的力场都是那些在模拟过程中要求键连关系保持不变的力场，没法研究MD过程的化学反应。反应力场才能描述这类问题，比如ReaxFF力场，lammps支持

吉布斯自由能你还是没说清楚，一般能算的是溶解自由能、反应对应的自由能变（需要反应力场或从头算动力学）等等。

作者
Author: 模拟小菜鸟 时间: 2019-5-4 21:20
老师您好，我想问的就是反应对应的自由能变

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-5 06:44

模拟小菜鸟发表于 2019-5-4 21:20
老师您好，我想问的就是反应对应的自由能变

GROMACS没法研究这个，原因前面说了

作者
Author: 模拟小菜鸟 时间: 2019-5-5 16:35
我明白了，谢谢老师！

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