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标题: 用packmol可以生成斜盒子吗？ [打印本页]

作者
Author: 万年流星 时间: 2019-4-30 10:14
标题: 用packmol可以生成斜盒子吗？
用packmol生成均相混合体系，由于加入的晶体为斜的，所以想做个斜盒子，请问各位大神怎么实现呐？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-4-30 11:25
packmol直接实现不了，只能之后自行用比如VMD切割

作者
Author: 万年流星 时间: 2019-4-30 15:43

sobereva 发表于 2019-4-30 11:25
packmol直接实现不了，只能之后自行用比如VMD切割

谢谢sob老师

作者
Author: 万年流星 时间: 2019-5-14 15:50

sobereva 发表于 2019-4-30 11:25
packmol直接实现不了，只能之后自行用比如VMD切割

老师怎么用VMD切割呐？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-14 20:22

万年流星发表于 2019-5-14 15:50
老师怎么用VMD切割呐？

保存文件时恰当使用选择语句设定选区。语法看VMD手册

作者
Author: 万年流星 时间: 2019-5-15 08:54

sobereva 发表于 2019-5-14 20:22
保存文件时恰当使用选择语句设定选区。语法看VMD手册

Thank you

作者
Author: shgpei 时间: 2019-7-8 10:56
用packmol导入晶面.pdb不会直接把晶面当成一个大分子吗？感觉packmol 构建带晶面的初始结构不可行

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