计算化学公社

标题: 分子体积计算的问题 [打印本页]

作者
Author: shalene 时间: 2019-5-5 00:28
标题: 分子体积计算的问题
在g09中用volume关键词做一结构的体积计算，出来的结果随scf方法变化而变化，差别还不小。

按照手册，这个体积是MC出来的。求科普，这与scf方法有什么关系

谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-5 06:36
仔细看此文
谈谈分子体积的计算
http://sobereva.com/102

volume是通过MC方法求的电子密度等值面内区域的体积，波函数不同，电子密度等值面就不同，体积就不同。
然而，你看到的现象绝非主要来自计算级别的差异，绝大部分原因来自于MC方法自身的随机性。如果你用Multiwfn的主功能12来计算体积（看上文），比volume关键词通过MC方法算体积准确得多，每次计算结果还精确相同，没有任何随机性，你也肯定不会看到仿佛是不同级别下算的结果相差很大的现象。
总之，强烈不建议用volume关键词算体积

作者
Author: shalene 时间: 2019-5-5 09:16
多谢社长

作者
Author: shalene 时间: 2019-5-5 21:02

sobereva 发表于 2019-5-5 06:36
仔细看此文
谈谈分子体积的计算
http://sobereva.com/102

用社长的MT方法，def2svp和def2tzvp出来的结果分别为810和817A3，结果是否正常？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-6 08:42

shalene 发表于 2019-5-5 21:02
用社长的MT方法，def2svp和def2tzvp出来的结果分别为810和817A3，结果是否正常？

很正常

作者
Author: 小毛毛 时间: 2019-12-13 20:32
我通过用Multiwfn的主功能12计算出来的体积，计算了覆盖率，覆盖率与实验值相差1~2个数量级，覆盖率能否做个校正？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-15 11:16

小毛毛发表于 2019-12-13 20:32
我通过用Multiwfn的主功能12计算出来的体积，计算了覆盖率，覆盖率与实验值相差1~2个数量级，覆盖率能否做 ...

我不晓得覆盖率怎么算的，估计你的计算模型太简单了，缺乏对实际因素的考虑，或者算法本身原理上就有明显问题

作者
Author: PESPES 时间: 2023-5-6 16:38

sobereva 发表于 2019-5-5 06:36
仔细看此文
谈谈分子体积的计算
http://sobereva.com/102

请问社长，如果是离子体积可以通过Multiwfn程序计算么？例如HOO-和EtO-的体积？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-5-6 19:04

PESPES 发表于 2023-5-6 09:38
请问社长，如果是离子体积可以通过Multiwfn程序计算么？例如HOO-和EtO-的体积？

仔细看那篇博文就会知道，sob老师说的计算分子体积的方法，在推导的时候完全没有用到分子不带电的条件。所以这个方法也是适用于离子的，只要你计算离子的理论级别合适（尤其是该加弥散函数的时候必须加）就行了

作者
Author: PESPES 时间: 2023-5-9 08:57

wzkchem5 发表于 2023-5-6 19:04
仔细看那篇博文就会知道，sob老师说的计算分子体积的方法，在推导的时候完全没有用到分子不带电的条件。 ...

好的，谢谢

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