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标题: 计算液氨电子结构所用的嵌入模型 [打印本页]

作者
Author: huangyoyo 时间: 2019-5-6 16:05
标题: 计算液氨电子结构所用的嵌入模型
这是一篇算液氨电子性质的文章。通过3部得到文章所需的结构：In the first, we use the gas-phase free optimized clusters. In the second, we use aggregates obtained from the liquid simulation without considering correction to the surface effects.Finally, in the third we embed these aggregates in the atomic charges of the remaining ammonia molecules, thus minimizing surface effects.第三步为了减少表面效应，将第二步得到的团簇嵌入到剩余氨分子的电荷中。我想请问这种嵌入模型是如何得到的？用嵌入模型和MD（文中所用的是NVE系综，N=216，密度=0.73g/cm3，T=197.2K）直接得到的模型计算出的结果有什么区别？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-7 07:47
我没时间细看，就大概看了一眼

electrostatic embedding provided
by the atomic charges of the remaining ammonia molecules
embedded clusters.

说明就是把周围的原子用背景电荷表现，数值就是其原子电荷。这是一种常用的表现环境原子对当前体系静电作用影响的常用手段。这也类似于QM/MM的考虑。

作者
Author: huangyoyo 时间: 2019-5-7 09:18

sobereva 发表于 2019-5-7 07:47
我没时间细看，就大概看了一眼

说明就是把周围的原子用背景电荷表现，数值就是其原子电荷。这是一种常用 ...

用这个嵌入模型可以应用于密度较大（0.8-1.5g/cm3）的氖气的TDDFT计算么？从文章看来这种嵌入模型可以减少表面效应的影响而且可以简化计算。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-7 09:46

huangyoyo 发表于 2019-5-7 09:18
用这个嵌入模型可以应用于密度较大（0.8-1.5g/cm3）的氖气的TDDFT计算么？从文章看来这种嵌入模型可以减 ...

这没有什么意义，Ne气里Ne的原子电荷几乎精确为0

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