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标题: 求助酰氯和胺反应寻找过渡态 [打印本页]

作者
Author: naoki 时间: 2019-5-6 23:54
标题: 求助酰氯和胺反应寻找过渡态
大家好，我想请教一个问题。我按Sob老师《简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3》（http://sobereva.com/460）对均苯三甲酰氯和间苯二胺在正己烷溶液中反应生成酰胺和氯化氢这一过程寻找过渡态，输入文件关键词：# opt=(calcfc,ts,noeigen) freq m052x/6-31g(d) scrf=(smd,solvent=n-hexane)，初猜结构位四面体过渡态，如下：
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然后得到的过渡态如下：
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虽然只有一个虚频，但是看起来不太对，我感觉我的化学直觉不行，可能初猜结构就不合理…想请教一下各位我的做法有没有问题，还有这个中间体初猜应该长什么样子…附件是找过渡态的输入和输出文件，有劳各位帮忙看看啦。谢谢大家！

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作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-7 08:10
你的初猜摆得明显没有这个反应的过渡态的模样。如果直接形成一个HCl掉下来，剩下的N上的氢和O应当处在彼此的对面

作者
Author: naoki 时间: 2019-5-7 10:16

sobereva 发表于 2019-5-7 08:10
你的初猜摆得明显没有这个反应的过渡态的模样。如果直接形成一个HCl掉下来，剩下的N上的氢和O应当处在彼此 ...

谢谢社长回答，主要是我不知道这个反应是SN1还是SN2还是四面体机理，还不知道有没有中间体。Schotten-Baumann反应好像各种机理都有报道。您说的很对，最后产物酰胺键的氧和氮上氢肯定处于对位，但这个结构应该算产物结构了，感觉中间经历了构象翻转，我再按您说的调整初猜试试。

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