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标题: 求助：VASP运行报错请教 [打印本页]

作者
Author: 飞翔的猪 时间: 2019-5-8 09:56
标题: 求助：VASP运行报错请教
本帖最后由飞翔的猪于 2019-5-8 16:50 编辑

大家好，我想请问一下：我是在自己电脑上面运行VASP，系统：Ubuntun16.04，vasp为5.4.4，计算体系：Cu-111-slab，4层，最下面两层固定，做slab结构优化

最近提交任务总是显示：Error reading item 'VCAIMAGES' from file INCAR，想请教是哪个部分出现了问题，谢谢

输入文件如下：
（1）INCAR

system=Cu111
ISTART=0
ICHARG=2
ENCUT=400
EDIFF=1E-4
EDIFFG=-0.01
NSW=200
IBRION=2
ISIF=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.1
LWAVE=.FALSE
LCHARG=.FALSE
PREC=High

(2)KPOINTS
Automatic Cu-111
0
Monkhorst-Pack
4 4 1
0 0 0

(3)POSCAR
Cu(111)
1.0
      5.1366000175       0.0000000000       0.0000000000
   -2.5683000088       4.4484261043       0.0000000000
      0.0000000000       0.0000000000       21.2910003662
Cu
16
Selective Dynamics
Cartesian
+0.0000000000 +0.0000000000 +0.0000000000 F F F
+2.5683257585 +1.4827939267 +2.0969505409 F F F
-0.0000257524 +2.9656324400 +4.1941142047 T T T
+0.0000000000 +0.0000000000 +6.2910652140 T T T
-1.2841500044 +2.2242131233 +0.0000000000 F F F
+1.2841758748 +3.7070069299 +2.0969505409 F F F
+1.2841243727 +0.7414191966 +4.1941142047 T T T
-1.2841500044 +2.2242131233 +6.2910652140 T T T
+1.2841500044 +2.2242131233 +0.0000000000 F F F
-1.2841243754 +3.7070069299 +2.0969505409 F F F
+3.8524241452 +0.7414191966 +4.1941142047 T T T
+1.2841500044 +2.2242131233 +6.2910652140 T T T
+2.5683000088 +0.0000000000 +0.0000000000 F F F
+0.0000256316 +1.4827939267 +2.0969505409 F F F
+2.5682740201 +2.9656324400 +4.1941142047 T T T
+2.5683000088 +0.0000000000 +6.2910652140 T T T

(4)POTCAR: PAW_GGA Cu

运行后会发生报错：
running on 4 total cores
distrk:  each k-point on 4 cores, 1 groups
distr:  one band on 1 cores, 4 groups
using from now: INCAR
vasp.5.4.4.18Apr17-6-g9f103f2a35 (build Apr 26 2019 19:12:43) complex

POSCAR found type information on POSCAR  Cu
POSCAR found :  1 types and    16 ions
scaLAPACK will be used
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
Fatal error in PMPI_Alltoallv: Other MPI error, error stack:
PMPI_Alltoallv(665).............: MPI_Alltoallv(sbuf=0xc2b3f00, scnts=0xbe90da0, sdispls=0xbe90d00, MPI_INTEGER, rbuf=0xc2c5b20, rcnts=0xbe90ea0, rdispls=0xbe90e00, MPI_INTEGER, comm=0xc4000003) failed
MPIR_Alltoallv_impl(416)........: fail failed
MPIR_Alltoallv(373).............: fail failed
MPIR_Alltoallv_intra(226).......: fail failed
MPIR_Waitall_impl(221)..........: fail failed
PMPIDI_CH3I_Progress(623).......: fail failed
pkt_RTS_handler(317)............: fail failed
do_cts(662).....................: fail failed
MPID_nem_lmt_dcp_start_recv(302): fail failed
dcp_recv(165)...................: Internal MPI error!  Cannot read from remote process
Two workarounds have been identified for this issue:
1) Enable ptrace for non-root users with:
echo 0 | sudo tee /proc/sys/kernel/yama/ptrace_scope
2) Or, use:
I_MPI_SHM_LMT=shm

尝试了输入： echo 0 | sudo tee /proc/sys/kernel/yama/ptrace_scope 显示无效

作者
Author: hakuna 时间: 2019-5-8 10:47
加个参数：IALGO=48
试试看
另：正经计算441不够

作者
Author: 飞翔的猪 时间: 2019-5-8 10:55

hakuna 发表于 2019-5-8 10:47
加个参数：IALGO=48
试试看
另：正经计算441不够

谢谢你的回复，我加了这个参数，还是会同样报错

作者
Author: 灰天皮匠 时间: 2019-5-8 12:03
google搜了一下你这个报错信息，好像是vasp没找到INCAR文件，你用vim重新写一次INCAR试试。

作者
Author: hakuna 时间: 2019-5-8 12:35

飞翔的猪发表于 2019-5-8 10:55
谢谢你的回复，我加了这个参数，还是会同样报错

低版本的VASP算不下去，换了一5.4.4版本的跑了8步就正常结束了

作者
Author: 飞翔的猪 时间: 2019-5-8 14:59

灰天皮匠发表于 2019-5-8 12:03
google搜了一下你这个报错信息，好像是vasp没找到INCAR文件，你用vim重新写一次INCAR试试。

你好谢谢你的回复，我重新写了INCAR之后可以运行，但是运行了几秒中之后出现了MPIR_Alltoallv_impl(416)........: fail failed
MPIR_Alltoallv(373).............: fail failed
的报错，之前算bulk都正常

作者
Author: 飞翔的猪 时间: 2019-5-8 15:00

hakuna 发表于 2019-5-8 12:35
低版本的VASP算不下去，换了一5.4.4版本的跑了8步就正常结束了

你好，我的vasp是5.4.4，不知道是不是因为我在自己电脑上面算的才会失败了

作者
Author: hakuna 时间: 2019-5-8 18:02

飞翔的猪发表于 2019-5-8 15:00
你好，我的vasp是5.4.4，不知道是不是因为我在自己电脑上面算的才会失败了

你串行跑一下看看能不能算下去

像是你的MPI有问题

作者
Author: 飞翔的猪 时间: 2019-5-16 15:45
这个问题已经解决，感谢这个帖子给的解决方法：https://cndaqiang.github.io/2018 ... A%E9%94%99%E8%AF%AF

作者
Author: hopedream 时间: 2023-1-26 08:36

飞翔的猪发表于 2019-5-16 15:45
这个问题已经解决，感谢这个帖子给的解决方法：https://cndaqiang.github.io/2018/01/15/intel-mpi-vasp/#% ...

我也遇到了这样的错误，是什么原因啊

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