计算化学公社
标题:
求助 gmx_mpi编译时openmpi遇到问题
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作者Author:
晓滨MD
时间:
2019-5-8 11:12
标题:
求助 gmx_mpi编译时openmpi遇到问题
遇到两个问题,想跟各位老师请教一下:
按照sob老师GROMACS的安装方法编译mpi版本,在
http://www.open-mpi.org
网站下载的openmpi-4.0.1,然后按照
http://sobereva.com/409
中的方法修改源码时出现几个问题1.
orte/tools/orte-dvm/orte-dvm.c并没有找到orte-dvm这个目录,而且也没有搜到
2.发现
orte-submit.c还是和openmpi3.x一样在这个目录
orte/orted/orted_submit.c
作者Author:
tomwong4253
时间:
2019-5-8 14:00
1. 如果你对自己的linux技术没有十足的把握,还是别一直在root下运行各种软件。
2. 仅仅是gmx编译时,只要配好环境变量就够了,运行时不在root下并不会有那样的提示。
3. 不同版本那个文件的位置可能移动,非要修改的话,做好备份再改。
作者Author:
sobereva
时间:
2019-5-8 16:58
版本不同,具体做法肯定不同
不管哪个版本,都是用grep在源代码里搜,找对应的文件。要举一反三
作者Author:
晓滨MD
时间:
2019-5-8 19:29
sobereva 发表于 2019-5-8 16:58
版本不同,具体做法肯定不同
不管哪个版本,都是用grep在源代码里搜,找对应的文件。要举一反三
好的,谢谢老师
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