计算化学公社

标题: 求助 gmx_mpi编译时openmpi遇到问题 [打印本页]

作者
Author:
晓滨MD    时间: 2019-5-8 11:12
标题: 求助 gmx_mpi编译时openmpi遇到问题
遇到两个问题,想跟各位老师请教一下:
按照sob老师GROMACS的安装方法编译mpi版本,在http://www.open-mpi.org网站下载的openmpi-4.0.1,然后按照http://sobereva.com/409中的方法修改源码时出现几个问题1.orte/tools/orte-dvm/orte-dvm.c并没有找到orte-dvm这个目录,而且也没有搜到
2.发现orte-submit.c还是和openmpi3.x一样在这个目录orte/orted/orted_submit.c

作者
Author:
tomwong4253    时间: 2019-5-8 14:00
1. 如果你对自己的linux技术没有十足的把握,还是别一直在root下运行各种软件。

2. 仅仅是gmx编译时,只要配好环境变量就够了,运行时不在root下并不会有那样的提示。

3. 不同版本那个文件的位置可能移动,非要修改的话,做好备份再改。
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-5-8 16:58
版本不同,具体做法肯定不同
不管哪个版本,都是用grep在源代码里搜,找对应的文件。要举一反三
作者
Author:
晓滨MD    时间: 2019-5-8 19:29
sobereva 发表于 2019-5-8 16:58
版本不同,具体做法肯定不同
不管哪个版本,都是用grep在源代码里搜,找对应的文件。要举一反三

好的,谢谢老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3