计算化学公社

标题: 读入fch生成密度矩阵时SIGSEGV fault [打印本页]

作者
Author:
lnxj99    时间: 2019-5-10 03:03
标题: 读入fch生成密度矩阵时SIGSEGV fault
各位,我最近在用Linux版本的multiwfn_3.6_dev,载入fch文件的时候遇到了问题,具体log见帖子最后。
我使用的compiler是intel/2017.1版本,在超算上做的编译,程序可以正常启动。
我有两个fchk文件,其中一个fchk文件,直接在读入阶段生成密度矩阵这一步会直接报错中止;而另一个文件可以正常读入,可以正常做basin分析,生成cube时,可以用0,0生成所有吸引子basin的cube文件。但是当要具体生成某一个吸引子的cube时,遇到了同样的fault。
我查到Intel开发者论坛对这个问题有一个回答:增加stacksize可以解决80%的这类问题。然而,我哪怕用512GB内存的机器,把KMP_STACKSIZE设定到500000000000做serial running,依旧会报错。换成windows版本的话,可以正常读入,说明应该不是内存不够。
在multiwfn英文论坛上查到另一篇帖子,但它的问题和我不太一样,我是直接无法读入。
不知道有没有人遇到类似的问题并解决了的?

感谢!

------------以下为serial running with 500 GB stacksize的返回信息----------------
Please wait...
Loading various information of the wavefunction
The highest angular moment basis functions is H
Loading basis set definition...
Loading orbitals...
Converting basis function information to GTF information...
Generating overlap matrix...
Back converting basis function information from Cartesian to spherical type...
Generating density matrix based on SCF orbitals...
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
Multiwfn           00000000019BE773  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread-2.17.s  00007F2DB645F370  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn           00000000004ED2B2  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn           00000000006B211E  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn           0000000000661D89  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn           00000000007128B6  Unknown               Unknown  Unknown
Multiwfn           0000000000430922  Unknown               Unknown  Unknown
libc-2.17.so       00007F2DB60B0B35  __libc_start_main     Unknown  Unknown
Multiwfn           0000000000430829  Unknown               Unknown  Unknown

--------------------------------------------


作者
Author:
sobereva    时间: 2019-5-10 10:02
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
看此文Q21
作者
Author:
lnxj99    时间: 2019-6-16 05:04
sobereva 发表于 2019-5-10 10:02
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452
看此文Q21

感谢卢老师,最后没有弄清楚到底什么原因,换windows机器强行花长时间做完了,再次感谢。




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