计算化学公社

标题: 体系是否平衡与计算RDF问题 [打印本页]

作者
Author: 你微笑时好Mg 时间: 2019-5-15 21:18
标题: 体系是否平衡与计算RDF问题
背景：有机分子A+有机溶剂B+水体系，以B改善A的分散稳定性
（1）目前有点迷糊如何判断体系已经达到平衡？上个帖子Sob老师说可以计算A的sasa，或者氢键之类的：A的sasa图是这样的 (, 下载次数 Times of downloads: 47) ：然后我又计算了B的sasa (, 下载次数 Times of downloads: 50) 以及B和水之间的氢键数目 (, 下载次数 Times of downloads: 35) ：这两张图可以说体系大约在5ns已经达到平衡了吗？A的sasa图该怎么解释？(目前小服务器跑的，体系比较小，跑了em-nvt-npt-md）
（2）RDF的计算是不是计算体系达到平衡后的时间段才有意义？
（3）感谢解答！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-16 00:20
1
5ns基本平衡了
A没什么好解释的
2 是

作者
Author: 你微笑时好Mg 时间: 2019-5-16 08:33

sobereva 发表于 2019-5-16 00:20
1
5ns基本平衡了
A没什么好解释的

好的，谢谢sob老师！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)