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标题: Multiwfn做AIM分析时,为什么键长越短反而没有BCP了呢? [打印本页]

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zhf0102    时间: 2019-5-17 10:43
标题: Multiwfn做AIM分析时,为什么键长越短反而没有BCP了呢?
各位老师好:
   我在用Multiwfn做AIM分析时,在相同的计算水平下,键长越短反而没有BCP了,我举的两个例子C-Al和C-Ga都是这样的。
我想问的是:该如何解释这样的结果呢?  或者还能通过什么其他的手段能解释呢?

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sobereva    时间: 2019-5-17 17:16
你这种体系成键方式特殊(Al的金属性强,电子分布比较弥散),可能存在赝原子。光用默认的搜索方式,首先就没法确保所有(3,-1)搜索全。这种电子密度分布复杂的情况应当用拓扑分析界面里选项6里面的选项-1在每个原子附近随机撒点来进行临界点搜索。然后再看临界点分布情况

这种体系Cl-Al之间没有一般意义的化学键,建议你先用ELF或LOL或价层电子密度的等值面图了解一下这个体系的大体电子结构特征,再结合BCP去讨论。不要光被BCP的位置在哪、有没有出现蒙在鼓里。
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zhf0102    时间: 2019-5-17 17:55
sobereva 发表于 2019-5-17 17:16
你这种体系成键方式特殊(Al的金属性强,电子分布比较弥散),可能存在赝原子。光用默认的搜索方式,首先就 ...

嗯嗯,明白了,多谢sob老师~
我先按照您的提示,做一下其他的分析。
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zhf0102    时间: 2019-5-18 12:56
sobereva 发表于 2019-5-17 17:16
你这种体系成键方式特殊(Al的金属性强,电子分布比较弥散),可能存在赝原子。光用默认的搜索方式,首先就 ...

Sob老师您好,我按照您的提示做了两件事:
1)拓扑分析选项选择了6,然后选了-1,仍然没有BCP;
2)然后我进行了ELF和LOL分析,我以前问过您关于ELF的类似问题。
我先自我分析一下,从ELF上可以明显看出两处发生了变化,(1) 对于CAl4,C原子周围橙色向Al方向鼓出,较为均匀;而对于CAl3SiCl, 数字1的位置的橙色明显鼓出变少,即说明C-Al1之间离域性变强。(2)  Al1-Al2之间,从CAl4到CAl3SiCl,明显变为红色,说明Al1-Al2之间定域性变强。    对于CAl3Ga同理。

LOL和ELF的结果基本一致。

我想问的是:sob老师,(1)我分析的对吗? (2) 从ELF和LOL分析上,能看出与BCP有什么关系吗?或者能和BCP联系起来吗?
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sobereva    时间: 2019-5-18 19:42
我这里只关注你一开始提到的有没有BCP的那个C与Al的作用。至于其它的原子间的作用,可以结合Mayer键级进一步讨论,如果和Mayer键级的结论也能对上,那就没错。
LOL图对当前体系看起来更清楚,所以看LOL就够了。所有体系中,C都没有冲着上方的Al出现显著的橙色区域,所以应当认为这俩原子间没有什么显著的相互作用。至于有没有出现BCP,完全没法作为是否有显著相互作用的证据,在下文中专门强调了这点。因此当前情况就认为这俩原子间没成键就完了,不要对有没有BCP这个现象做过度解释,是否出现并不具备化学意义。
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
作者
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zhf0102    时间: 2019-5-19 09:37
sobereva 发表于 2019-5-18 19:42
我这里只关注你一开始提到的有没有BCP的那个C与Al的作用。至于其它的原子间的作用,可以结合Mayer键级进一 ...

谢谢sob老师的回答,我仔细看了您的博文。简单的总结:“BCP算是存在化学键的必要非充分条件”。
我还是有疑问 (sob老师,我下面的问题是真的来求知的)
您昨天回答说看我的LOL图,LOL图确实看不出C-Al之间有相互作用。
1)那我是否可以根据ELF图来说,从CAl4-->CAl3SiCl,C-Al之间相互作用是减弱的;同理从CAl3Ga-->CAl2SiGaCl,C-Ga之间的相互作用是减弱的。这样理解可以吗?
2)有一篇文献讲CO3Li3+(https://pubs.rsc.org/en/content/ ... 41822c#!divAbstract) 是6配位碳,其中C-Li键长,文中是根据其与共价键差不多,所以认为C-Li之间成键。
文献中没有做AIM ELF LOL等分析,我做一下这些分析,如果按照sob老师您说的,这些分析方法如何解释这个C-Li成键呢?
3) 2)中提到的C-Li成键形式和我给出的例子有什么区别呢?

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sobereva    时间: 2019-5-20 02:38
1 用Multiwfn绘制填色图的时候应当让原子标签(符号+序号)显示在图上,要不然我不好判断原子的位置,而且图里有多个Al,也不清楚你说的是哪个Al。通过颜色不好分辨的话,都建议通过键级或者BCP的属性再进一步验证一下。

C-Ga那么说可以

2 这种体系从化学直觉上就知道是Li与O之间的离子键。键长已经反映了成键,从图上看,O上的电子基本还是处于CO3里孤对电子分布的特征,没有因为与Li形成共价作用而被显著极化。

3 我没时间看文章。明显C和Li没有成键。
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zhf0102    时间: 2019-5-20 09:23
sobereva 发表于 2019-5-20 02:38
1 用Multiwfn绘制填色图的时候应当让原子标签(符号+序号)显示在图上,要不然我不好判断原子的位置,而且 ...

谢谢sob老师的回答\(^o^)/  您的建议,我在下一次提问的时候,一定把图做好,把原子标签都放上,以便观看。

我提供文献网址的意图,忘记和您说了,我不是想让您去看。我是想如果有其他小伙伴遇到类似的问题,可以去看一下文献,方便其他人查找文献。




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