计算化学公社

标题: 计算紫外,需要考虑boltzmann分布吗 [打印本页]

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kibZHF    时间: 2019-5-21 10:03
标题: 计算紫外,需要考虑boltzmann分布吗
最近在学习用gaussian09计算紫外,请问大家,计算紫外需要考虑构象的玻尔兹曼分布吗,还是只计算一个构象,谢谢!

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kibZHF    时间: 2019-5-21 10:16
计算ECD时,也会出来紫外谱图,但是和实测的对不大上,多了几个峰,最大吸收峰差了10nm,不知道是不是根据这个算紫外校正
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liyuanhe211    时间: 2019-5-21 10:18
需要。有时非常重要。

另外有的人只挑一个构象算甚至会挑错。
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sobereva    时间: 2019-5-21 10:18
仔细看
使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱
http://sobereva.com/383http://bbs.keinsci.com/thread-6186-1-1.html

ECD对构象极为敏感,UV-Vis敏感性虽然更低,但该考虑还是要考虑

区区10nm根本算不上什么显著误差,倒不如说运气好误差才这么点

没有所谓的什么“紫外校正”

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lsg1215    时间: 2020-7-22 17:26
sobereva 发表于 2019-5-21 10:18
仔细看
使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱
http://sobereva.com/383(http://bbs.keinsci.com/thread-6 ...

老师,我想请教一下UV校正在什么情况下使用?另外,还有一个问题向您请教,有时候结构的绝对构型定不下来,计算的时候会对几个非对应异构体计算ECD,这样的话在最后的实测和计算ECD比对时,偶尔会出现移动不同的波长能和两种或者更多结构匹配上,导致无法确定绝对构型,出现这样的问题应该怎么办呢?
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sobereva    时间: 2020-7-23 00:13
lsg1215 发表于 2020-7-22 17:26
老师,我想请教一下UV校正在什么情况下使用?另外,还有一个问题向您请教,有时候结构的绝对构型定不下来 ...

没听说过所谓“UV校正”
如果你用的理论方法经过别人测试发现有明显系统性偏差,那可以再考虑进行修正

你说的情况得具体问题具体分析,不好一概而论

作者
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lsg1215    时间: 2020-7-23 13:45
sobereva 发表于 2020-7-23 00:13
没听说过所谓“UV校正”
如果你用的理论方法经过别人测试发现有明显系统性偏差,那可以再考虑进行修正
...

谢谢老师




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