计算化学公社

标题: 请各位老师看看我对过渡态搜索和能量的表达是否正确 [打印本页]

作者
Author: 心辉 时间: 2019-5-22 16:00
标题: 请各位老师看看我对过渡态搜索和能量的表达是否正确
本帖最后由心辉于 2019-5-22 16:13 编辑

新手学习过渡态的搜索，学习了一些东西但是还是有些模棱两可的东西，所以在这里总结一下我的过程，想让各位老师检查一下，看下是否有错误。第一步，
在 B3LYP/6-31G(d)的函数与基组的条件下，优化过渡态与中间体，并做频率分析，判断标准是中间体没有虚频，过渡态有且只有一个虚频。
高斯的关键词是：中间体-# opt freq b3lyp/6-31g(d)
过渡态-# opt=(ts,calcfc,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d)
然后最后在计算的结果中读取能量：Thermal Correction to Free Energy (标记为E1)
第二步，
在之前计算结构的基础上，用 B3LYP/6-311G(d)的函数与基组下，加上D3校正，与SMD溶剂模型。计算单点能
高斯的关键词是：# b3lyp/6-311g(d) scrf=(smd,solvent=methylbenzene) EmpiricalDispersion=GD3BJ
然后最后在计算的结果中读取能量：HF (标记为E2)

然后最后读取的能量是E3=E1+E2

不知道这要做是不是对的，哪里有错希望各位老师能指出来，谢谢各位老师

作者
Author: Frank 时间: 2019-5-22 18:27
http://sobereva.com/327
看社长的这个帖子，学习分别怎么准确计算气相自由能和溶剂化自由能。

作者
Author: 心辉 时间: 2019-5-22 21:20

Frank 发表于 2019-5-22 18:27
http://sobereva.com/327
看社长的这个帖子，学习分别怎么准确计算气相自由能和溶剂化自由能。

好的谢谢您

作者
Author: sobereva 时间: 2019-5-23 00:29
B3LYP叫泛函不叫函数

加D3算单点没有理由优化不加，仔细看此文
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题
http://sobereva.com/415（http://bbs.keinsci.com/thread-9878-1-1.html）

其它问题在2L提到的文章中有详细说明

作者
Author: 心辉 时间: 2019-5-26 11:11

sobereva 发表于 2019-5-23 00:29
B3LYP叫泛函不叫函数

加D3算单点没有理由优化不加，仔细看此文

好的谢谢您的指导

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)