计算化学公社

标题: Linux系统下无法运行gaussian软件 [打印本页]

作者
Author: hwu0712 时间: 2019-5-28 10:33
标题: Linux系统下无法运行gaussian软件
按照社长的教程在centos7.4系统下安装了g09，运行任务后立即出现错误，由于是刚入门的小白，麻烦大家看一下是什么问题，非常感谢!

[hwu0712@localhost ~]$ g09 triethylenetetramine salt.gjf
Unable to open input file "triethylenetetramine.com" or "triethylenetetramine.gjf".
Error: segmentation violation
rax 0000000000000000, rbx 0000000000000018, rcx ffffffffffffffff
rdx 0000000000003777, rsp 00007ffdc9557398, rbp 00007ffdc955e8d0
rsi 000000000000000b, rdi 0000000000003777, r8  00002ac05172d2c0
r9  0000000000000000, r10 00007ffdc9556de0, r11 0000000000000202
r12 ffffffffffffffff, r13 00007ffdc955e9d0, r14 0000000000000000
r15 0000000000000000
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf5d0) [0x2ac0519255d0]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2ac051e6a4d7]
  g09() [0x407627]
  g09() [0x4039f5]
  g09() [0x40358d]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2ac051e563d5]
  g09() [0x403489]
Aborted (core dumped)

作者
Author: niobium 时间: 2019-5-28 10:40
看不懂提示吗？
Linux下文件名中间不能有空格，你这样是变成了两个文件

作者
Author: hwu0712 时间: 2019-5-28 10:57

niobium 发表于 2019-5-28 10:40
看不懂提示吗？
Linux下文件名中间不能有空格，你这样是变成了两个文件

谢谢您的回复。我将文件名中间的空格去掉后出现了如下问题，麻烦帮看一下，谢谢

hwu0712@localhost ~]$ g09 triethylenetetramine.gjf
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /home/hwu0712/g09/tmp/Gau-11336.inp
In source file ml0.f, at line number 195
  g09() [0x42ba08]
  g09() [0x42cdca]
  g09() [0x42c74c]
  g09() [0x404229]
  g09() [0x40358d]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2b8abc76c3d5]
  g09() [0x403489]
Aborted (core dumped)

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2019-5-28 11:00

hwu0712 发表于 2019-5-28 10:57
谢谢您的回复。我将文件名中间的空格去掉后出现了如下问题，麻烦帮看一下，谢谢

hwu0712@localhost ~] ...

去 Google 或者 YouTube 找 “Linux 入门” 从早到晚看上一天再在Linux上做计算。不会亏的。

不要问“如何上Google”或“如何上YouTube”

除了“如何上Google”之外不要在百度搜索东西。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2019-5-28 11:02

hwu0712 发表于 2019-5-28 10:57
谢谢您的回复。我将文件名中间的空格去掉后出现了如下问题，麻烦帮看一下，谢谢

hwu0712@localhost ~] ...

这是scratch路径没有写入权限，高斯环境变量没写对。

作者
Author: hwu0712 时间: 2019-5-28 11:08

liyuanhe211 发表于 2019-5-28 11:00
去 Google 或者 YouTube 找 “Linux 入门” 从早到晚看上一天再在Linux上做计算。不会亏的。

不要问“ ...

谢谢您的建议

作者
Author: hwu0712 时间: 2019-5-28 11:09

zjxitcc 发表于 2019-5-28 11:02
这是scratch路径没有写入权限，高斯环境变量没写对。

非常感谢！

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