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标题: (已解决)求助,有没有人用insane脚本构建体系? [打印本页]

作者
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路过的一只    时间: 2019-5-28 18:50
标题: (已解决)求助,有没有人用insane脚本构建体系?
本帖最后由 路过的一只 于 2019-5-31 09:42 编辑

用insane脚本直接构建蛋白+膜的体系很方便,可是有个问题是,-center的命令会自动使得蛋白居中嵌入膜中……可是我想做的跨膜蛋白位置相对于居中要偏下些……-orient的命令,蛋白很可能就不在膜中……
不知道怎么才能实现我想要的位置了,求教/拱手
(已解决)

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zwy123    时间: 2023-8-11 21:30
怎么用insane脚本构建不对称单层膜啊,求助!
作者
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CAOPEIFANG    时间: 2024-10-22 21:52
请问楼主是怎么解决的啊,刚接触粗粒化模拟,不知道该怎么用insane.py使得蛋白质的跨膜区域正好在膜内
作者
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CAOPEIFANG    时间: 2024-10-22 22:38
CAOPEIFANG 发表于 2024-10-22 21:52
请问楼主是怎么解决的啊,刚接触粗粒化模拟,不知道该怎么用insane.py使得蛋白质的跨膜区域正好在膜内

解决了,-dm: 相对于膜移动蛋白质。只需要在命令加:-dm -5.0,意思是将蛋白质向下移动 5.0 nm
作者
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HEQIYUE    时间: 2025-10-6 13:35
求一个insane.py的文件可以吗?找到的一直是旧版的,不适用python3





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