计算化学公社

标题: 用Multiwfn做出的福井函数图，可以用VMD表示吗？ [打印本页]

作者
Author: 郭严1993 时间: 2015-6-26 16:03
标题: 用Multiwfn做出的福井函数图，可以用VMD表示吗？
用Multiwfn做出的福井函数图，由于是立体分子，不方便观察，如图，双键和氧原子附近都多较大的电子云分布，并不能看出哪里的亲电活性更大，是不是这些点都表示有一定的活性，到底谁的活性更大不能区分？另外能不能用vmd来做图，这样可以更直观些，从Multiwfn只能得到一个density.cub文件，导入VMD之后只能得到分子结构，并不能显示电子密度分布。（从接触这个软件以来已经问了好多问题，都有点不好意思了，还请老师不要见怪~

作者
Author: sobereva 时间: 2015-6-26 17:36
你若想得到定量的数值就计算简缩福井函数，每个原子上都一个具体的值，讨论起来方便，看手册4.7.3节。

基于cube文件在VMD里绘制等值面图极容易，看此贴的过程，怎么用分子轨道的cube文件在VMD里显示等值面。
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

作者
Author: 郭严1993 时间: 2015-6-27 20:42
谢谢老师~

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)