计算化学公社

标题: dalton2018计算中断问题求助 [打印本页]

作者
Author: Aivor 时间: 2019-6-4 22:25
标题: dalton2018计算中断问题求助
本帖最后由 Aivor 于 2019-6-5 18:38 编辑

各位老师好，我在运行dalton2018时发生中断，中断位置如下：

****************************************************************************
*************** Output of molecule and basis set information ***************
****************************************************************************

The two title cards from your ".mol" input:
------------------------------------------------------------------------
1: test molecule
2: Generated by Multiwfn
------------------------------------------------------------------------

  Coordinates are entered in Angstrom and converted to atomic units.
      - Conversion factor : 1 bohr = 0.52917721 A

后面输出文件中就没有任何信息了，请问一下这是发生了什么问题？非常感谢。
以下是我的dal和mol文件。
**DALTON INPUT
.RUN RESPONS
**INTEGRALS
.MNF-SO
**WAVE FUNCTIONS
.DFT
B3LYP
*DFT INPUT
.DFTD3
*SCF INPUT
**RESPONS
*QUADRATIC
.MNFPHO
.PRINT
3
.ROOTS
3
**END OF INPUT

Content of the .mol file
----------------------------

ATOMBASIS
test molecule
Generated by Multiwfn
Atomtypes=5 Angstrom Nosymmetry charge=0
Charge=1.0 Atoms=42 Basis=cc-pVDZ

作者
Author: sobereva 时间: 2019-6-4 23:17
最好上传完整的输入文件

作者
Author: Aivor 时间: 2019-6-5 09:29

sobereva 发表于 2019-6-4 23:17
最好上传完整的输入文件

输入文件以及输出文件都已上传，请老师赐教。

作者
Author: heheda 时间: 2019-6-5 10:09
mol文件里
Charge=1.0 Atoms=32 Basis=cc-pVDZ
H1 10.44767000 -1.64426800 0.00720900 应该改成Atoms=22
它指的是氢原子一共22个。
Charge=6.0 Atoms=44 Basis=cc-pVDZ
C1 10.93624500 -3.71979100 -0.30140800应该改成Atoms=33
它指的是碳原子一共33个。

作者
Author: Aivor 时间: 2019-6-5 15:08

heheda 发表于 2019-6-5 10:09
mol文件里
Charge=1.0 Atoms=32 Basis=cc-pVDZ
H1 10.44767000 -1.64426800 0.00720900 应该改成A ...

感谢您的回复，但是我不太懂。事实上H原子就是32个，要改成22个的依据是什么呢？您也说这里的Atom是指原子个数，那又为啥要设置的与实际的原子个数不一致呢？

作者
Author: Aivor 时间: 2019-6-5 15:27

sobereva 发表于 2019-6-4 23:17
最好上传完整的输入文件

老师：http://bbs.keinsci.com/thread-12120-1-1.html我就是按照您这个帖子上操作的，过程中没有报错提示，只是它会中断，我现在不知道问题出现在哪儿了。

作者
Author: heheda 时间: 2019-6-5 15:45

Aivor 发表于 2019-6-5 15:08
感谢您的回复，但是我不太懂。事实上H原子就是32个，要改成22个的依据是什么呢？您也说这里的Atom是指原 ...

我直接看的out文件，out文件里列出了那么多。
刚又看了mol文件，C原子的数目也不对啊，列出了44个，前面的数目写的43.

作者
Author: sobereva 时间: 2019-6-5 18:47
原子数没问题。Multiwfn产生的mol文件在原子数上是不会错的。

我用2019 alpha版跑了一下，虽然有别的报错，但至少不是程序停在你说的地方，如下所示。怀疑是你的Dalton本身装的有问题。最好先拿最简单的任务，比如就跑个DFT单点进行测试

...略
  Coordinates are entered in Angstrom and converted to atomic units.
      - Conversion factor : 1 bohr = 0.52917721 A

  Atomic type no. 1
  --------------------
  Nuclear charge: 1.00000
  Number of symmetry independent centers: 32
  Number of basis sets to read; 2
  The basis set is "cc-pVDZ" from the basis set library.
  Basis set file used for this atomic type with Z = 1 :
   "/sob/dalton/basis/cc-pVDZ"

  Atomic type no. 2
  --------------------
  Nuclear charge: 6.00000
  Number of symmetry independent centers: 44
  Number of basis sets to read; 2
  The basis set is "cc-pVDZ" from the basis set library.
  Basis set file used for this atomic type with Z = 6 :
   "/sob/dalton/basis/cc-pVDZ"
...略

作者
Author: Aivor 时间: 2019-6-16 16:09
好的，谢谢老师的指导。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)