计算化学公社

标题: NVT跑完出现断层求助 [打印本页]

作者
Author:
wfmf1994    时间: 2019-6-5 09:53
标题: NVT跑完出现断层求助
各位老师,我在模拟一个体系的时候,本来盒子是充满的,结果跑完后出现了断层(图2,红色部分在mdp中被冻结),且盒子两边也出现了较大的空隙(图1),请问这是为什么呢?应该怎么去调整?
注:各部分在拼合前都跑了npt并已打平衡,然后拼合后,已跑完能量最小化(已收敛)

作者
Author:
sobereva    时间: 2019-6-5 10:24
一般都是因为密度太低,凝聚紧密之后自然就留出空隙了

跑NPT的时候记得对于这种体系必须用半各项同性控压,顺着纳米管和垂直于纳米管的平面方向控压必须是独立的。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3