计算化学公社
标题:
NVT跑完出现断层求助
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作者Author:
wfmf1994
时间:
2019-6-5 09:53
标题:
NVT跑完出现断层求助
各位老师,我在模拟一个体系的时候,本来盒子是充满的,结果跑完后出现了断层(图2,红色部分在mdp中被冻结),且盒子两边也出现了较大的空隙(图1),请问这是为什么呢?应该怎么去调整?
注:各部分在拼合前都跑了npt并已打平衡,然后拼合后,已跑完能量最小化(已收敛)
作者Author:
sobereva
时间:
2019-6-5 10:24
一般都是因为密度太低,凝聚紧密之后自然就留出空隙了
跑NPT的时候记得对于这种体系必须用半各项同性控压,顺着纳米管和垂直于纳米管的平面方向控压必须是独立的。
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