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标题: 求助chemshell接口QM/MM优化报错 [打印本页]

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Author: jiang012582 时间: 2019-6-10 11:48
标题: 求助chemshell接口QM/MM优化报错
本帖最后由 jiang012582 于 2019-6-11 15:30 编辑

使用chemshell接口利用QM/MM来优化分子，首先将单晶保存为pdb文件，放到MS里重新按类型排列原子保存为pdb文件，将坐标拷入super.pdb作为输入文件，首先结合高斯在进行resp静电势电荷拟合，应用于amber力场，将得到的1.inpcrd和1.prmtop文件在chemshell力场下进行优化，优化基态S0出现以下报错
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请问老师这可能是哪里出错了，是在拟合静电势电荷出错了吗?这是我的文件
我也没有搜到具体解决方法，麻烦有懂的老师帮忙看看，谢谢谢谢

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Author: sobereva 时间: 2019-6-10 12:15
和原子电荷不像有任何直接关系
这种很小众程序基本搜不到有用信息，联系开发者最快
8成是调用量化程序计算QM部分时候存在异常，诸如QM计算用的模型不合理，结果导致提示的HOMO-LUMO gap非常小的警告

作者
Author: jiang012582 时间: 2019-6-10 14:57
老师这个是可能是我把单晶放到mercury里面选择packing and slicing堆积构建的模型不合理吗，谢谢老师

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Author: sobereva 时间: 2019-6-11 10:29

jiang012582 发表于 2019-6-10 14:57
老师这个是可能是我把单晶放到mercury里面选择packing and slicing堆积构建的模型不合理吗，谢谢老师

这和个没有必然关系。得肉眼查看结构判断有无异常

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Author: jiang012582 时间: 2019-6-11 15:22
谢谢老师

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