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标题: 求助xtb并行设置问题 [打印本页]

作者
Author: hzamber 时间: 2019-6-17 17:23
标题: 求助xtb并行设置问题
xtb可以用OMP并行设置。使用xtb --help得到并行设置如下：
export MKL_NUM_THREADS=<NCORE>
export OMP_THREAD_LIMIT=<NCORE>
export OMP_NUM_THREADS=${OMP_THREAD_LIMIT},1
export OMP_STACKSIZE=500m
ulimit -s unlimited

社长博文http://sobereva.com/421中设置如下：
export OMP_NUM_THREADS=N
export MKL_NUM_THREADS=N
export OMP_STACKSIZE=1000m
ulimit -s unlimited

问题一：两种设置是否等效？

问题二：xtb计算有效利用内存？
使用2核，4G电脑测试计算。
使用如下设置：
export OMP_NUM_THREADS=2
export MKL_NUM_THREADS=2
export OMP_STACKSIZE=1000m
ulimit -s unlimited
使用xtb进行opt+freq计算，内存利用率整个过程不超过4%。内存利用率不高，是不是设置有问题？

问题三：OMP_STACKSIZE设置多大合理？
如16核，64G电脑，OMP_STACKSIZE设置多大合理？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-6-17 20:47
1 一样

2 无问题，本来就耗不了那么大内存，仔细看
硬盘速度与内存容量对量子化学计算速度影响的测试
http://sobereva.com/397（http://bbs.keinsci.com/thread-7478-1-1.html）

3 能跑就行了，设再大也没用。跑不了再尝试增大

作者
Author: hzamber 时间: 2019-6-17 22:47

sobereva 发表于 2019-6-17 20:47
1 一样

2 无问题，本来就耗不了那么大内存，仔细看

谢谢！

作者
Author: tjuptz 时间: 2021-1-8 20:19

sobereva 发表于 2019-6-17 20:47
1 一样

2 无问题，本来就耗不了那么大内存，仔细看

export OMP_NUM_THREADS=${OMP_THREAD_LIMIT},1
老师，这句的意思是omp线程在1-N之间还是，就是N啊。我试了下好像这样还是N

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