计算化学公社

标题: 请问gromacs中如何计算水分子占体系的质量分数，有没有可用的程序？ [打印本页]

作者
Author: wh.shen 时间: 2019-6-20 19:54
标题: 请问gromacs中如何计算水分子占体系的质量分数，有没有可用的程序？
[求助]:请问gromacs中如何计算水分子占体系的质量分数，有没有可用的程序？

作者
Author: wh.shen 时间: 2019-6-20 21:41
搞明白了，用pdb2gmx处理时就会输出个部分质量的信息

作者
Author: sobereva 时间: 2019-6-21 00:13
结构文件载入VMD，命令行窗口运行
measure sumweights [atomselect top all] weight mass 得到整个体系总质量
measure sumweights [atomselect top waters] weight mass 得到水的总质量
之后自行一除便知

作者
Author: wh.shen 时间: 2019-6-21 09:31

sobereva 发表于 2019-6-21 00:13
结构文件载入VMD，命令行窗口运行
measure sumweights [atomselect top all] weight mass 得到整个体系总 ...

多谢sob老师，还是用VMD方便一些

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)