计算化学公社

标题: 双光子吸收计算求助 [打印本页]

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yuiop    时间: 2019-6-20 22:00
标题: 双光子吸收计算求助
本帖最后由 yuiop 于 2019-7-17 15:43 编辑

各位老师好,最近老师要求计算双光子分子的相关性质,但是本人是新手,组内以前没有过涉及过相关计算,有些问题想请教大家:
1. OPA和TPA吸收光谱的计算:看一些文献上计算方法写的是用gaussian进行TDDFT计算,但是我不太清楚关键词该怎么写。在论坛上搜索了一下,OPA吸收光谱是像普通分子一样计算,直接在S0结构上#p td b3lyp/6-31g(d)吗?双光子的吸收谱又该写哪些关键词?
2. 跃迁偶极矩:请问这是和普通的单光子吸收分子一样计算吗?还有激发态的偶极矩需要优化激发态结构吗?
3. TPA λmax:请问这个用高斯如何计算?而且应该取哪个激发态,我看到文献上不都是S1,是要振子强度不为0就行,还是算很多个态取振子强度最大的,还是其它什么判别方法?
4. 双光子吸收截面:看到一些文献使用dalton计算的,我也查了一下,但是关于输出文件的解读不太会,如下是我在网上下载的一个dalton计算双光子的部分输出文件,请问sigma是双光子吸收截面吗?这里的很多参数都又分为Linear和Circular Polarization,应该取哪个?
麻烦各位坛友和老师指导一下,谢谢大家!
                   +-----------------------------------+
                   |   Two-photon absorption summary   |
                   +-----------------------------------+
   ---------------------------------------------------------------------------------
   Sym  No  Energy  Polarization         Df         Dg          D      sigma       R
   ---------------------------------------------------------------------------------
     1   1    3.08   Linear       0.740E+02  0.829E+02  0.479E+03  0.334E+01    0.73
     1   1    3.08   Circular     0.740E+02  0.829E+02  0.349E+03  0.243E+01    0.73

       Rotationally averaged two-photon transition strengths

                       and rate constants

       +-------------------+----------------+----------------+
       |   Polarization    |    DELTA_TP    |   K (0 -> f)   |
       +-------------------+----------------+----------------+
       |  linear (para)    | 479.48261585   |  0.154302E-18  |
       +-------------------+----------------+----------------+
       |  linear (perp)    | 340.34499908   |  0.109527E-18  |
       +-------------------+----------------+----------------+
       |    circular       | 349.21210845   |  0.112380E-18  |
       +-------------------+----------------+----------------+



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heheda    时间: 2019-6-24 14:41
我也不是太懂,下面是个人的一些浅显见解,不对的地方请大家批评指正!
1.OPA吸收光谱既可以用Gaussian,也可以用Dalton计算,一般都用Gaussian,具体指令参照sob老师写的《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法》。
TPA信息只能用Dalton计算,计算的dal文件需要参照手册自己编写,mol文件生成方法:把fch文件拖入Multiwfn,进入主功能100,依次再选2,19.
2.跃迁偶极矩的算法好多帖子都有
3.TPA 我没见过λmax,只有σmax
4.好多老师说文件里直接输出的sigma并不是双光子吸收截面,可以自己编个脚本根据D(微观双光子吸收截面)计算一下σ。Linear和Circular Polarization分别是线偏振和圆偏振,看自己的实验条件做出选择。
作者
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yuiop    时间: 2019-6-24 15:31
heheda 发表于 2019-6-24 14:41
我也不是太懂,下面是个人的一些浅显见解,不对的地方请大家批评指正!
1.OPA吸收光谱既可以用Gaussian, ...

好的,谢谢您!我再去学习学习。
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sobereva    时间: 2019-6-25 04:29
GAMESS-US也可以做TPA计算,在$TDDFT里添加TPA=.TRUE.即可
作者
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yuiop    时间: 2019-6-25 09:42
sobereva 发表于 2019-6-25 04:29
GAMESS-US也可以做TPA计算,在$TDDFT里添加TPA=.TRUE.即可

好的,谢谢老师!不过我们组里目前只有gaussian和dalton,GAMESS-US没有使用经验,我再去查查相关资料吧。
作者
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yuiop    时间: 2019-7-12 22:06
heheda 发表于 2019-6-24 14:41
我也不是太懂,下面是个人的一些浅显见解,不对的地方请大家批评指正!
1.OPA吸收光谱既可以用Gaussian, ...

老师,您好!我最近在重复文献,但是计算结果一直和文献不符,所以想再请教您一下。如下是我用Dalton计算TPA的dal文件:
**DALTON                                          
.RUN RESPONSE                                    
**WAVE FUNCTIONS                                 
.HF                                               
**RESPONSE                                       
*QUADRATIC                                       
.TWO-PHOTON                                       
.ROOTS                                            
10                                                
**END OF INPUT
请您帮忙看下是不是有什么问题。
另外,请问TPA波长是用1240/Energy*2得到的吗?因为我这样能到的和文献一致的TPA波长,但除此之外,无论是delta_TP还是sigma_TP,我计算得到的结果都和文献差很大。您说sigma不是TPA截面,请问如何计算得到双光子吸收截面?谢谢!
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heheda    时间: 2019-7-16 11:14
yuiop 发表于 2019-7-12 22:06
老师,您好!我最近在重复文献,但是计算结果一直和文献不符,所以想再请教您一下。如下是我用Dalton计算 ...

你把文献DOI号和你的结果文件贴出来吧,单独看dal文件也没啥问题,波长能对应说明应该是对的。后面的不对有可能是你公式理解错了,或者单位没有换算正确。
作者
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yuiop    时间: 2019-7-17 15:47
本帖最后由 yuiop 于 2019-7-17 15:49 编辑
heheda 发表于 2019-7-16 11:14
你把文献DOI号和你的结果文件贴出来吧,单独看dal文件也没啥问题,波长能对应说明应该是对的。后面的不对 ...

谢谢老师,我重复的是篇04年的中文文献,http://wulixb.iphy.ac.cn/CN/Y2004/V53/I7/2112#
我重复了该文中SB-DD分子的计算,以下是我的计算结果与文献值的对比:
SB-DD        i        ωi (eV)        δtp        λtp (nm)        σtp (GM)
文献        1        4.39        3.15E-02        564        1.48E-05
计算        1        4.39        3.30E+01        565         1.56E-02
文献        2        5.49        6.49E+03        452        4.78E+00
计算        2        5.49        6.48E+03        452         4.78E+00
文献        3        5.5        5.43E-01        452        3.95E-04
计算        3        5.5        1.31E+01        451         9.66E-03
文献        4        5.89        4.91E+04        420        4.16E+01
计算        4        5.88        4.89E+04        422         4.13E+01
文献        5        6.93        3.11E-02        358        3.60E-05
计算        5        6.93        2.18E+01        358         2.56E-02
附件是我计算的SB-DD的dalton输出文件。
我后来也重复了另外2篇文献,结果都和文献一致,不知道是不是因为这篇文献太老了,所以没算出来。麻烦您了!
作者
Author:
heheda    时间: 2019-7-17 20:33
你的计算和数据处理都是正确的,不要担忧。
作者
Author:
yuiop    时间: 2019-7-18 08:45
heheda 发表于 2019-7-17 20:33
你的计算和数据处理都是正确的,不要担忧。

好的,谢谢您,辛苦了!
作者
Author:
tiantianl    时间: 2019-11-25 19:57
yuiop 发表于 2019-7-17 15:47
谢谢老师,我重复的是篇04年的中文文献,http://wulixb.iphy.ac.cn/CN/Y2004/V53/I7/2112#
我重复了该文 ...

同学你好,我刚接触理论计算,想问一下对于计算双光子特性的输出文件,你是怎么分析的呢?有没有什么具体说明书啥的?
作者
Author:
xxzj    时间: 2021-7-13 16:56
您好,我想请问一下,双光子吸收有具有的判定条件吗?比如带隙需要介于多少之间,我网上没有找到准确的标准,所以想向您请教一下
作者
Author:
chzhao-sdu    时间: 2022-1-23 21:31
你好,看到你双光子吸收的帖子,你现在知道怎样从Dalton输出文件中“Two-photon absorption summary"的数据计算双光子吸收截面吗?不知道能否告知一下,谢谢




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