计算化学公社
标题:
求助关于SMD下离子和自由基负离子反应的过渡态
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作者Author:
Somnus荣小荣
时间:
2019-6-24 10:32
标题:
求助关于SMD下离子和自由基负离子反应的过渡态
老师您好!求助,最近在做一个H-SO3-和CO3-自由基反应的过渡态,在没有催化剂的情况下,反应的过渡态顺利找到,机理是H原子转移过程,产物是SO3-自由基和HCO3-离子,但是能垒较高,速率常数较小跟实验对不上。所以考虑一个H2O作为催化剂充当H原子桥的传递作用。但是发现一直找不多过渡态,扫描也不成功(H2O在夺取H-SO3上的H的过程中,一直不把另外一个H给CO3-自由基,当然最后的一步也是会出现一个拐点,且得到产物,但该结构(几乎是H3O的结构)找不到过渡态。文件w-scan.log),我比较了一个没有H2O催化的结构和有H2O催化的结构,发现由于CO3-自由基相比CO32-少了一个电子,所以有一个键是相对其他两个键长一个点的,而也正是该键夺取H,在没有H2O催化的结构的TS等的过程中一直保持该键是最长的。但是当有一个H2O参与的情况,即使我放进去的结构是最长的键夺取H的取向,在随后的TS,扫描,或者优化的过程中感觉CO3-自由基的单电子是一直在动的,因为发现在每个键的键长一直在变化且准备夺取去H的键长现在变成最短的了,扫描的时候在最后一步突然变长。随后尝试了从产物到反应物的扫描也不成功(文件prod-scan),请教老师,这种情况该如何处理呢,找了好久实在没什么办法了。请老师指教,谢谢您!
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