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标题: isostat工具能否增加RMSD和转动常数筛阈值选结构？ [打印本页]

作者
Author: hzamber 时间: 2019-6-25 00:30
标题: isostat工具能否增加RMSD和转动常数筛阈值选结构？
社长是否对isostat工具增加RMSD和转动常数阈值筛选结构？
根据isostat工具中的能量偏差和几何偏差阈值筛选结构，有时候会把能量相近的rotamer漏选。
根据转动常数则可以进行筛选。

谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-6-25 03:13
对于大分子而言，转动常数不是一个对结构特征很“敏感”的量，所以以这个为标准我认为不是很合适
其实我不是很理解你要表达的意思，最好能提供给我相应的xyz文件，并且告诉我你设的isostat用的阈值、你想达到什么目的，我看看具体是什么情况

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