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标题: 求助:cvff立场能否用在Gromacs中 [打印本页]

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sjl    时间: 2019-6-26 14:58
标题: 求助:cvff立场能否用在Gromacs中
各位老师和同学们好:

      cvff立场有很多交叉项,特别是键角的交叉项的公式和gromacs中的公式有点不太一样,所以想请教一下:
      1. cvff立场能否用在Gromacs中,有没有什么可以近似的方法?
      2. 另外如果不能的话,什么立场能和clayff立场连用?(看文献有很多是clayff立场和cvff立场连用的)

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sobereva    时间: 2019-6-27 05:46
没法严格、方便实现。除非你考虑用列表势,或者自己改程序,或者把CVFF的曲线扫出来然后自己用gmx支持的函数形式重新拟合,但这样无疑很麻烦
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sjl    时间: 2019-6-27 09:50
好的,谢谢sob老师
作者
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Lacrimosa    时间: 2019-6-28 21:07
可以尝试一下INTERFACE力场,其官网上有interfaceff2gro程序可以生成相应的力场文件
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sjl    时间: 2019-6-30 21:02
Lacrimosa 发表于 2019-6-28 21:07
可以尝试一下INTERFACE力场,其官网上有interfaceff2gro程序可以生成相应的力场文件

好的,谢谢!我会去试试
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sjl    时间: 2019-7-2 13:42
Lacrimosa 发表于 2019-6-28 21:07
可以尝试一下INTERFACE力场,其官网上有interfaceff2gro程序可以生成相应的力场文件

可以给一下INTERFACE力场官网的网址吗?我找了许久没有找到,谢谢!
作者
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Lacrimosa    时间: 2019-7-2 16:32
sjl 发表于 2019-7-2 13:42
可以给一下INTERFACE力场官网的网址吗?我找了许久没有找到,谢谢!

https://bionanostructures.com/interface-md/
这里
作者
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sjl    时间: 2019-7-4 10:44
Lacrimosa 发表于 2019-7-2 16:32
https://bionanostructures.com/interface-md/
这里

谢谢!




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