计算化学公社

标题: Dmol3过渡态搜索时出现多个虚频该如何处理？ [打印本页]

作者
Author: AJ86 时间: 2019-6-27 15:39
标题: Dmol3过渡态搜索时出现多个虚频该如何处理？
请问各位老师，Dmol3过渡态搜索时出现多个虚频该如何处理？能否将过渡态搜索得到的.xsd文件直接进行TS opt, 计算时出现：“No normal mode information could be found on the model.
Please ensure that a normal mode has been selected and try again.”求老师指点一下，感谢

作者
Author: zorow 时间: 2019-6-27 17:01
算过渡态时候性质里有没有勾选频率？没有的话要先做个单点能计算性质勾选频率，然后才能做过渡态优化

作者
Author: AJ86 时间: 2019-6-27 17:21

zorow 发表于 2019-6-27 17:01
算过渡态时候性质里有没有勾选频率？没有的话要先做个单点能计算性质勾选频率，然后才能做过渡态优化

谢谢回复。算过渡态时勾选了频率，然后我用搜索得到的.xsd文件进行TS opt就出现上面的问题了

作者
Author: zorow 时间: 2019-6-27 20:07

AJ86 发表于 2019-6-27 17:21
谢谢回复。算过渡态时勾选了频率，然后我用搜索得到的.xsd文件进行TS opt就出现上面的问题了

应该先对得到的xsd文件做一下vibrational analysis，然后再做TS opt

作者
Author: AJ86 时间: 2019-6-27 20:24

zorow 发表于 2019-6-27 20:07
应该先对得到的xsd文件做一下vibrational analysis，然后再做TS opt

是指对某个频率做一个Animation吗？我计算的过渡态有6个虚频，不知道该对哪个频率处理

作者
Author: zorow 时间: 2019-6-27 21:22

AJ86 发表于 2019-6-27 20:24
是指对某个频率做一个Animation吗？我计算的过渡态有6个虚频，不知道该对哪个频率处理

看动画的振动方向，哪个和你的反应一致就保留哪个

作者
Author: AJ86 时间: 2019-6-27 22:29

zorow 发表于 2019-6-27 21:22
看动画的振动方向，哪个和你的反应一致就保留哪个

不一致的话，就对该频率下的结构进行TS opt吗？

作者
Author: zorow 时间: 2019-6-28 08:35

AJ86 发表于 2019-6-27 22:29
不一致的话，就对该频率下的结构进行TS opt吗？

不一致的轨迹文件不保留，只保留一致的轨迹文件，然后对TS search得到的结构做TS opt

作者
Author: AJ86 时间: 2019-6-29 19:23

zorow 发表于 2019-6-28 08:35
不一致的轨迹文件不保留，只保留一致的轨迹文件，然后对TS search得到的结构做TS opt

好的，非常感谢您

作者
Author: 战泽天 时间: 2019-10-30 12:49

zorow 发表于 2019-6-27 17:01
算过渡态时候性质里有没有勾选频率？没有的话要先做个单点能计算性质勾选频率，然后才能做过渡态优化

您好，我现在也在做过渡态搜寻，对过渡态搜寻得到的结构进行频率计算后出现多个虚频，请问是对选择的虚频轨迹做TS search 然后TS op消除虚频，还是对原来的TS search得到的xsd做TS op呢？

作者
Author: ZKW1005 时间: 2020-9-15 17:11
您好，打扰您一下。请问就是在做DMOL3过渡态搜索的时候出现多个虚频如何消去多的虚频。在过渡态搜索的时候在勾选频率，在搜索的结果中查看虚频的个数，这样操作是不是正确？

作者
Author: ZKW1005 时间: 2020-9-15 17:12

战泽天发表于 2019-10-30 12:49
您好，我现在也在做过渡态搜寻，对过渡态搜寻得到的结构进行频率计算后出现多个虚频，请问是对选择的虚频 ...

我也想知道是怎样操作的

作者
Author: lywbanner 时间: 2025-3-16 00:28

AJ86 发表于 2019-6-29 19:23
好的，非常感谢您

这些虚频都在一个xtd文件里，如何选择性保留啊？

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