计算化学公社

标题: 为什么很少有人用DL_POLY做模拟？ [打印本页]

作者
Author: 星球yxy 时间: 2019-7-2 10:05
标题: 为什么很少有人用DL_POLY做模拟？
我们一直是用DL_POLY做模拟，后来发现看到的大多数文章使用的以及公社中问的比较多的都是GROMACS和NAMD等程序，这些程序我没用过也不好比较，所以不知道为啥dl_poly的使用者这么少？- -或者也可能是我接触的文章还不够多？

作者
Author: shalene 时间: 2019-7-2 10:17
dl_poly速度太慢，比gromacs至少慢一个数量级

作者
Author: 星球yxy 时间: 2019-7-2 10:29

shalene 发表于 2019-7-2 10:17
dl_poly速度太慢，比gromacs至少慢一个数量级

是这样啊

我们一直用的dl_poly，可能这个速度对我们的研究来说已经够了吧

作者
Author: sobereva 时间: 2019-7-2 10:33
相对于主流、用户广泛的gromacs、lammps等，这个程序的使用必要性没那么高，亮点不够突出。不是你接触的文章不够多，是本身这个程序用的人就是少

作者
Author: Lacrimosa 时间: 2019-7-2 10:36
可能主要是领域的问题吧，材料方面好像还是有些人在用的，毕竟有些相关力场gmx不支持

作者
Author: 星球yxy 时间: 2019-7-2 10:54

sobereva 发表于 2019-7-2 10:33
相对于主流、用户广泛的gromacs、lammps等，这个程序的使用必要性没那么高，亮点不够突出。不是你接触的文 ...

好滴，谢谢

作者
Author: 星球yxy 时间: 2019-7-2 10:56

Lacrimosa 发表于 2019-7-2 10:36
可能主要是领域的问题吧，材料方面好像还是有些人在用的，毕竟有些相关力场gmx不支持

好滴，我们一直是做溶液化学，现在向材料方向转了

作者
Author: 少年爱吃地三鲜 时间: 2019-7-2 10:57
你要转软件的话务必看看想用啥力场，然后再选择lammps还是gromacs

作者
Author: granvia 时间: 2019-7-2 11:13
我算是DL_POLY的老用户，当时选它是觉得其简单好用。但其功能确实有不少局限。

作者
Author: ShuangfeiZhu 时间: 2019-7-2 13:01

granvia 发表于 2019-7-2 11:13
我算是DL_POLY的老用户，当时选它是觉得其简单好用。但其功能确实有不少局限。

最近想模拟磁场，看了看dl_poly的手册外场部分说能加磁场和电场，请问这个靠谱么？

作者
Author: shalene 时间: 2019-7-2 13:46

ShuangfeiZhu 发表于 2019-7-2 13:01
最近想模拟磁场，看了看dl_poly的手册外场部分说能加磁场和电场，请问这个靠谱么？

磁场靠谱。

因为模拟磁场才接触dlpoly，才知道原来这么慢

作者
Author: shalene 时间: 2019-7-2 13:49

星球yxy 发表于 2019-7-2 10:29
是这样啊我们一直用的dl_poly，可能这个速度对我们的研究来说已经够了吧

换成gromacs，你会惊喜的。

因为磁场模拟才接触dlpoly，慢得诧异

作者
Author: 星球yxy 时间: 2019-7-2 14:38

少年爱吃地三鲜发表于 2019-7-2 10:57
你要转软件的话务必看看想用啥力场，然后再选择lammps还是gromacs

好滴，谢谢喔

，不过暂时还是会跟着课题组用的

作者
Author: 星球yxy 时间: 2019-7-2 14:39

shalene 发表于 2019-7-2 13:49
换成gromacs，你会惊喜的。

因为磁场模拟才接触dlpoly，慢得诧异

哈哈，好滴，谢谢，有机会会去尝试

作者
Author: 王二葛 时间: 2019-7-2 21:13
DL_POLY 的磁场部分极其简陋，通过加外力 F = qv×B 实现的，用它做了几个月的磁场体系没有任何有用的结果。
现已转投 Lammps，使用其自带的 SPIN 包，但仍有很多问题需要解决。

作者
Author: plus 时间: 2019-7-3 10:40
chemshell内置模块，用QM/MM方法算生物体系一般都用它

作者
Author: 小雷森 时间: 2023-10-1 09:28

星球yxy 发表于 2019-7-2 10:29
是这样啊我们一直用的dl_poly，可能这个速度对我们的研究来说已经够了吧

您好，我用DL_POLY软件模拟半导体吸附，但是在构建输入文件时，DL_FIELD不识别我的晶体模型（CaSO4）。请问您遇到过吗？

作者
Author: zixinyang 时间: 2024-6-23 01:15

granvia 发表于 2019-7-2 11:13
我算是DL_POLY的老用户，当时选它是觉得其简单好用。但其功能确实有不少局限。

你好，想问一下用dlpoly做模拟时，怎么快速生成输入文件，CONTROL文件中的cutoff设置有什么讲究

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