计算化学公社

标题: 求助nbo7计算服务器多核并行方法 [打印本页]

作者
Author: 心辉 时间: 2019-7-15 10:51
标题: 求助nbo7计算服务器多核并行方法
我们课题组在服务器上安装了nbo7，使用的脚本./gennbo.sh提交的任务，
但是这样只能调用一个服务器的核心，怎么才能使得gennbo这个任务多核并行

./gennbo.sh的脚本如下
#!/bin/bash

#  Set environment variables:

export JOB=/home/jiao/nbo7/yingduo
export NBOFIL=$1
export NBODTL=$2

#  Locate the NBO7 binaries directory:

export NBOBIN=/home/jiao/nbo7/bin

#  Set INT manually (to i4 or i8):

export INT=i8

#  Identify executables:

export NBOEXE=$NBOBIN/nbo7.$INT.exe
export GENEXE=$NBOBIN/gennbo.$INT.exe

#  Ensure that executables exist:

if [ ! -e $NBOEXE ]
  then
echo "NBO executable is missing in the $NBOBIN directory"
  exit
fi
if [ ! -e $GENEXE ]
  then
echo "GenNBO executable is missing in the $NBOBIN directory"
  exit
fi

#  Delete the old output file, if it exists:

if [ -e $JOB.nbo ]
  then
rm -i $JOB.nbo
fi
if [ -e $JOB.nbo ]
  then
exit
fi

($GENEXE $JOB.47 > $JOB.nbo) >& /dev/null &

作者
Author: sobereva 时间: 2019-7-15 11:35
我没听说过NBO能并行

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Author: 心辉 时间: 2019-7-15 15:51

sobereva 发表于 2019-7-15 11:35
我没听说过NBO能并行

那就完全靠单核性能了是么？好的谢谢您老师

作者
Author: sobereva 时间: 2019-7-15 20:19

心辉发表于 2019-7-15 15:51
那就完全靠单核性能了是么？好的谢谢您老师

本来NBO的绝大部分分析耗时就不高，是否并行化意义不大，主要也就是NRT分析很耗时。速度只看单核性能

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Author: 心辉 时间: 2019-7-16 09:02

sobereva 发表于 2019-7-15 20:19
本来NBO的绝大部分分析耗时就不高，是否并行化意义不大，主要也就是NRT分析很耗时。速度只看单核性能

嗯嗯好的谢谢您

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