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基于已优化的结构初猜的过渡态,优化出来的结构却没有连接到这个结构式
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作者Author:
hyj
时间:
2019-7-19 10:18
标题:
基于已优化的结构初猜的过渡态,优化出来的结构却没有连接到这个结构式
大家好,我计算的是酯基旁边beta碳上的氢转移到胺的氮上。图是反应物(发生氢转移的部位是用蓝线标出来的地方),由于beta碳与氮相距较远,拉近group,使它们距离缩短些,由此初猜了氢转移的过渡态(是先用6-31g*基组找到过渡态,后又采用6-311g*基组优化),做irc发现这个过渡态在产物一侧确实连接了之前优化出的极小点,但是反应物一侧的结构却不是我优化出来的结构。我想知道对于这个已经连接产物的过渡态,它与反应物之间存在一个中间体,是不是这个过渡态就可以是这个反应的过渡态,而不存在直接连接反应物与产物的过渡态(这种单分子的反应不存在像那种多分子反应物或多分子产物那种的复合物中间体吧?)现在不知道怎么解释irc连接的反应物一侧了,求高人指点。
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