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标题: 求助 关于用ORCA几何优化 [打印本页]

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晓滨MD    时间: 2019-7-22 21:42
标题: 求助 关于用ORCA几何优化
新手刚刚开始学用ORCA,根据sob老师的方法产生的输入文件,基组是B97-3c,对几个有机小分子进行了几何优化和振动分析,有几个问题想请教各位老师:
1.怎样通过ORCA的输出文件判断几何优化和SCF收敛?
2.几何优化完成之后,会产生优化完的.xyz结构文件,我想用优化完的结构文件交给antechamber产生拓扑文件,试了好几种方法一直不成功,还请各位老师指点一下。

作者
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sobereva    时间: 2019-7-23 17:40
计算没报错,正常结束的话,自然几何优化收敛了,而且每步也都SCF收敛了
用openbabel之类转换成mol2格式,就能当antechamber输入文件了
作者
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晓滨MD    时间: 2019-7-23 18:30
sobereva 发表于 2019-7-23 17:40
计算没报错,正常结束的话,自然几何优化收敛了,而且每步也都SCF收敛了
用openbabel之类转换成mol2格式, ...

谢谢老师
作者
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量化小菜鸡    时间: 2019-7-24 17:07
你仔细读输出文件,假如几何不收敛跑过了圈数。最后有个warning。
作者
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晓滨MD    时间: 2019-7-24 17:10
量化小菜鸡 发表于 2019-7-24 17:07
你仔细读输出文件,假如几何不收敛跑过了圈数。最后有个warning。

好的,谢谢
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biogon    时间: 2019-7-25 12:55
量化小菜鸡 发表于 2019-7-24 17:07
你仔细读输出文件,假如几何不收敛跑过了圈数。最后有个warning。

orca优化不收敛是不是跑过了圈数只提示个warning?
作者
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量化小菜鸡    时间: 2019-7-25 15:40
biogon 发表于 2019-7-25 12:55
orca优化不收敛是不是跑过了圈数只提示个warning?

印象里还会继续算,给你个最后输出。所以最好自己看一下。
作者
Author:
Xian    时间: 2019-8-7 11:16
楼主注意啦,我优化一个结构,虽然程序正常结束,但是有这个warning

   ----------------------------------------------------------------------------
                                  WARNING !!!
       The optimization did not converge but reached the maximum number of
       optimization cycles.
       Please check your results very carefully.
    ----------------------------------------------------------------------------

其实结构是没有优化好的呢。
作者
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晓滨MD    时间: 2019-8-9 09:17
Xian 发表于 2019-8-7 11:16
楼主注意啦,我优化一个结构,虽然程序正常结束,但是有这个warning

   ------------------------------ ...

嗯嗯,好的 谢谢。每次优化完都会检查输出文件
作者
Author:
喵星大佬    时间: 2020-8-28 08:53
晓滨MD 发表于 2019-8-9 09:17
嗯嗯,好的 谢谢。每次优化完都会检查输出文件

B97-3c这个方法蛮容易几何优化不收敛的。可能是用了RI导致数值噪音比较大的原因吧。优化小配合物分子也经常要几百步





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