计算化学公社

标题: 高斯振动模式的分析能够得到什么信息？ [打印本页]

作者
Author: drz0918 时间: 2015-7-4 22:05
标题: 高斯振动模式的分析能够得到什么信息？
看完Sobereva 的帖子 Gaussian中分析振动模式成份的关键词freq=intmodes，觉得很有意思，但是对于这种振动模式的分析能够得到什么信息呢？对这个物质的键还是结构上还是电子上的有什么影响呢？
这种动画是怎么从高斯中输出来的呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2015-7-4 23:17
用gview打开freq任务的输出文件，然后在results-vibration界面里就可以选Save Movie将振动的动画导出为gif格式的动画文件。

intmodes这种分析主要是为了帮助指认振动模式的成份。分子振动中各个几何变量相互耦合的，往往播放振动动画的时候会看到很多原子一起在运动，通过intmodes可以考察每个几何变量的贡献，由此便于讨论振动模式所主要表现的特征。
对于成键分析倒是没什么用处。

作者
Author: zidu113 时间: 2015-7-5 08:46
推荐看看Cotton,Chemical Applications of Group Theory，里面有用群论分析分子振动，讲的很好。

作者
Author: lastzealot 时间: 2015-7-5 13:06
又学到了

作者
Author: drz0918 时间: 2015-7-21 22:35
本帖最后由 drz0918 于 2015-7-21 22:49 编辑

zidu113 发表于 2015-7-5 08:46
推荐看看Cotton,Chemical Applications of Group Theory，里面有用群论分析分子振动，讲的很好。

我下载不了这本书。。。没法看。
你能告诉我这个振动模式为什么会有那么多种，都是代表什么意思呢？
能给出什么信息呢？有的振动模式中只包含键伸缩，有的只包含二面角扭转，有的包含好几项

作者
Author: sobereva 时间: 2015-7-22 06:31

drz0918 发表于 2015-7-21 22:35
我下载不了这本书。。。没法看。
你能告诉我这个振动模式为什么会有那么多种，都是代表什么意思呢？
...

有3N-6个内坐标，因此有3N-6种振动模式，某种意义类似于原子轨道->分子轨道的变换
看看这些文章有帮助
Potential energy distribution(PED)计算软件GAR2PED使用简介
http://sobereva.com/75
Gaussian中分析振动模式成份的关键词freq=intmodes
http://sobereva.com/106
PED分析软件VEDA4简介
http://sobereva.com/183

作者
Author: zidu113 时间: 2015-7-22 14:11

drz0918 发表于 2015-7-21 22:35
我下载不了这本书。。。没法看。
你能告诉我这个振动模式为什么会有那么多种，都是代表什么意思呢？
...

根据群论，每一种振动模式实际对应着分子所属点群的一种不可约表示，所以对应相应的频率。

作者
Author: zidu113 时间: 2015-7-22 14:38
本帖最后由 zidu113 于 2015-7-22 15:10 编辑

zidu113 发表于 2015-7-22 14:11
根据群论，每一种振动模式实际对应着分子所属点群的一种不可约表示，所以对应相应的频率。

稍稍展开点说：
（1）假如一个分子里有n个原子，因为每个原子有3个自由度，所以这个含有n个原子的分子总共有3n个自由度，但是我们讨论的是分子的内振动，所以需要去掉整个分子在x,y,z三个轴向的整体平动和转动，所以对于3n个自由度，需要减去这6个自由度，剩下的3n-6才是真正的分子内振动（注：对于直线分子是3n-5）。
（2）下面说说这3n-6(3n-5)个振动模式，其实从群表示的角度看，对应的是一组正则坐标，这组坐标对应该分子所属点群的一个不可约表示。具体怎样得到的，建议还是看看书。不是很难，我的印象里，大致就是，因为分子里的每个原子都有三个坐标，那么用分子中这所有3n个坐标作为基，得到该分子的一个表示，这个表示是可约的，很容易就能将这个可约表示約化为该分子所属点群的各个不可约表示，这些不可约表示对应的就是该分子的正则振动模式。在约化过程中，那些最初坐标也组合成相应的正则坐标。每一个不可约表示（振动模式）对应一个频率，有点像每一个不可约波函数对应的本征值就是一个能量。
（3）需要说明的是，从群论的角度，只能得到定性的结论，不可能得到任何定量的结果。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)