计算化学公社
标题:
产物结构优化到了反应物
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作者Author:
chenxin199261
时间:
2014-10-29 19:59
标题:
产物结构优化到了反应物
我在重复一个文献。这个文献在追踪一个氢转移反应里程。
氢从一个底物上转移到一个络合物上。
我在对发生氢转移后的产物进行优化时,氢原子竟然优化回到了底物上面(产物)。请问怎么避免这个情况????
我geom=connectivity,把氢连到了络合物上。最后还是优化回去了。
chk文件开头部分:
==================================================================
1 %chk=I-BnTPEN-TPM.chk
2 %nprocshared=24
3 %mem=2GB
4 # opt freq rb3lyp geom=connectivity
5
6 Title Card Required
===================================================================
作者Author:
sobereva
时间:
2014-10-29 20:12
geom=connectivity没有任何用处。
只能确保初猜的结构离产物尽量接近。优化算法一般都会优化到距离初猜结构最近的极小点。
或者如果有过渡态的话,可以走IRC,生成的IRC路径两头会通向反应物和产物结构。
作者Author:
chenxin199261
时间:
2014-10-29 22:08
sobereva 发表于 2014-10-29 20:12
geom=connectivity没有任何用处。
只能确保初猜的结构离产物尽量接近。优化算法一般都会优化到距离初猜结 ...
是我看书不细
自定义基组没用打开genecp,默认sto-3g计算。
麻烦你了,要是换了基组还有这个问题,再说。
谢谢!~~~~
作者Author:
shx
时间:
2014-11-2 18:13
我觉得你可以扫描一些这个转移过程,通过势能曲线判断路径是否合理
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