计算化学公社

标题: 模拟晶体结构，离子怎么赋予？晶体结构为共价有机框架 [打印本页]

作者
Author: iniway 时间: 2019-8-2 17:26
标题: 模拟晶体结构，离子怎么赋予？晶体结构为共价有机框架
大佬们好。我在用MS搭建晶体结构，是共价有机框架COF，单体是咪唑类离子型，PF6-为负离子，请问怎么把PF6-放置，要怎么赋予初始电荷吗？

作者
Author: tjuptz 时间: 2019-8-7 10:35
没有单晶CIF文件吗？可以参考http://bbs.keinsci.com/thread-3884-1-1.html试试

作者
Author: iniway 时间: 2019-8-8 16:04

tjuptz 发表于 2019-8-7 10:35
没有单晶CIF文件吗？可以参考http://bbs.keinsci.com/thread-3884-1-1.html试试

建模我会。单晶的模型已经搭好了。就是不知道电荷怎么赋予。骨架有一部分是阳离子，pf6负离子我是人为地放置在阳离子附件，几何优化的时候pf6会偏离较远。想知道有没有方法让它固定在阳离子部分附近。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)