计算化学公社

标题: 这个xTB的PBC还有待完善 [打印本页]

作者
Author: coolrainbow 时间: 2019-8-6 07:22
标题: 这个xTB的PBC还有待完善
试了个最简单的苯晶体，结果还算不错。
但是换了个复杂的，比如一个400原子的金属氧化物，就立即segment fault，连ulimit -s unlimited都不管用（64GB内存应该够了吧）。

不过有这个快速半经验的固体计算程序已经很令人激动了，估计最慢一年的时间这个程序就能完善。到时候就大有可为。

作者
Author: h840473807 时间: 2019-8-6 09:19
可以带PBC跑动力学吗

作者
Author: pyscf 时间: 2019-8-6 09:57
建议楼主测试一下mopac的pbc
看看哪个速度快些...

作者
Author: plus 时间: 2019-8-6 10:18
用xtb主要是有金属的参数

作者
Author: captain 时间: 2019-8-6 12:17
现在只能做几何优化吧

作者
Author: biogon 时间: 2019-8-6 14:05

h840473807 发表于 2019-8-6 09:19
可以带PBC跑动力学吗

好像还不行

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2019-8-6 15:42
老版本删的太快，gfn0参数没了

作者
Author: Novice 时间: 2019-8-6 15:56

yjmaxpayne 发表于 2019-8-6 15:42
老版本删的太快，gfn0参数没了

附件是前几天论坛里另一个帖子有人回复的，请自取

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2019-8-7 06:53

Novice 发表于 2019-8-6 15:56
附件是前几天论坛里另一个帖子有人回复的，请自取

多谢

作者
Author: plus 时间: 2019-8-7 08:22
更新以后可以啊

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2019-8-7 14:45
8月6号的Bug修正版挺好，gfn0参数也有了。

作者
Author: Novice 时间: 2019-8-7 14:56

yjmaxpayne 发表于 2019-8-7 14:45
8月6号的Bug修正版挺好，gfn0参数也有了。

这个修正版里面包含的文件怎么这么少，怎么没有GFNx的文件了？但却多了一些其他的文件，难道是用来替换的？

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2019-8-7 16:06

Novice 发表于 2019-8-7 14:56
这个修正版里面包含的文件怎么这么少，怎么没有GFNx的文件了？但却多了一些其他的文件，难道是用来替换的 ...

应该是，参数文件啥的，都包含在前一个版本了。

作者
Author: get-it 时间: 2019-8-8 11:43

h840473807 发表于 2019-8-6 09:19
可以带PBC跑动力学吗

如果用ase的接口，可以跑pbc的动力学

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2019-8-14 10:01
最近跑了几个PBC的测试，大体系（~400原子），效率不够高，12个核并行只有2X多的加速。小体系（~60原子），并行效率还可以，8核8倍加速。

作者
Author: yjmaxpayne 时间: 2019-9-10 18:08
近期的6.2版本（2019-08-28）版，似乎大体系的效率问题解决了。 12核，~400原子的体系，可以保证接近12倍的加速。不过，还有待继续测试。

作者
Author: tjuptz 时间: 2020-4-6 20:45
拿CaCO3试了下，原胞和小的超胞直接优化散了，不知是我用的超胞太小还是确实目前的参数不太理想.....

作者
Author: coolrainbow 时间: 2020-4-7 12:43

tjuptz 发表于 2020-4-6 20:45
拿CaCO3试了下，原胞和小的超胞直接优化散了，不知是我用的超胞太小还是确实目前的参数不太理想.....

离子晶体非常容易翻车

作者
Author: tjuptz 时间: 2020-4-7 20:44

coolrainbow 发表于 2020-4-7 12:43
离子晶体非常容易翻车

真心希望xtb能更强大一些，感觉这玩意又快用起来用简单

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