标题: 关于MD density的理解疑惑 [打印本页] 作者Author: 18217265596 时间: 2019-8-7 11:32 标题: 关于MD density的理解疑惑 我在过amber tutorials http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial0/index.htm的时候
看到计算结果关于MD density的描述During the 20-80ps, the density equilibrates to approximately 1 g/cm^3. This corresponds to a change in periodic box dimensions as the density of the system converges.
教程的density最终趋近于1g/cm3 我个人对这个概念不是很理解
1，它的物理意义是什么？
2，是不是它稳定就代表体系收敛
3，我用GAFF算的一个28个单元的类肽，MD density在我的计算时间内从60涨到80，我想让他收敛除了加时间还有什么办法吗