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标题: 求助柔性扫描找ts，结果看着像没有ts，想问变量是否设置正确？ [打印本页]

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Author: 哈哈哈 时间: 2019-8-10 09:00
标题: 求助柔性扫描找ts，结果看着像没有ts，想问变量是否设置正确？
本帖最后由哈哈哈于 2019-8-10 10:41 编辑

想找一个H从N上提取到O上反应的过渡态，用OPT=TS方法没找到，想用柔性扫描试试。
先优化了H与OH成键的结构，然后走H由O到N的柔性扫描。
文件中是柔性扫描的输出，从结果上看没有过渡态，我想这个应该有个过渡态哦，所以想问问是否我柔性扫描变量没设置对。

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Author: pcxlm1 时间: 2019-8-10 15:45
记得在sob老师文章里提过不推荐用柔性扫描找过渡态，但是如果实在找不到也许可以一试。
柔性扫描是沿着感兴趣的角度和化学键走势能面，走的过程中其它原子的位置都在不断变化以适应新的最低能量结构。而过渡态这种鞍点，很有可能在优化当中落到鞍点的一侧或者另一侧，从而导致即使有过渡态也无法通过柔性扫描准确得到。当然，也有一定概率落在离鞍点比较近的一个稳定结构，以它为初始结构在opt=ts可能能找到过渡态。上面是我的理解，相信没有帮到你，后面的大佬会有高招的。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-11 05:58

pcxlm1 发表于 2019-8-10 15:45
记得在sob老师文章里提过不推荐用柔性扫描找过渡态，但是如果实在找不到也许可以一试。
柔性扫描是沿着感 ...

我从没有“不推荐用柔性扫描找过渡态”（本身柔性扫描也根本没法找到过渡态），而是我反对那些明明很容易通过手动摆个初猜就能找到过渡态的场合，某些人非要做一次昂贵的柔性扫描来确定过渡态初猜，甚至有的初学者以为做一次柔性扫描是找过渡态“必经的过程”，不仅多做一步，还造成大量的时间浪费。
自己不好确定过渡态初猜的时候、反复摆都不成功的时候，显然通过柔性扫描帮助确定初猜是很有益的。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-11 06:10
首先你的计算级别不合适。涉及氢转移的过程应当给氢加上极化函数。确认有没有过渡态应当用更像样的级别，诸如基组用def-TZVP（卟啉部分非重点，仍用6-31G*也可以）

如果用更理想的级别还没过渡态，说明这个过程可能就是没过渡态。毕竟氢转移到OH上的趋势很强，而断裂当前分子的N-H的难度没那么大，造成的能量上升因素可能不够强而导致过渡态出现不了。

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