计算化学公社

标题: 【高中生求助】想完成研究性学习，急 [打印本页]

作者
Author: Synthesis 时间: 2019-8-12 21:56
标题: 【高中生求助】想完成研究性学习，急
本帖最后由 Synthesis 于 2019-8-17 23:50 编辑

情况是这样的，我是高一升高二的高中生，现在一方面是为了好玩，一方面为了研究性学习，现在已经到了用量化计算软件模拟过渡态的阶段。困难集中在两方面：1，找不到免费的、可以在家里的笔记本上使用的计算软件；2，就算有也不会用，网上的教程看起来耗费时间会有点多，9月7号就要化竞国初了，而9月中旬就要中期答辩，真没时间自己研究。

所以我需要以下两个方面的帮助：1，免费的计算软件安装包来源；2，教教我入门方法，只要最基础的过渡态计算，能绘制出过渡态并算出活化能就可以了，毕竟答辩对象也就是中学老师。若能提供帮助，本人感激不尽！

（ps：我的课题是“p-pai共轭体系中单键顺反异构现象的探究”，我的意图是模拟顺反异构化的过渡态并计算其常温下的大致反应速率，以此进行研究。大家如果能给一些关于该课题的高中生可行的其他建议，创新方向也可以告诉我）（实验除外，实验要等开学再做）

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-13 06:51
对于你的情况，免费程序里能用的也就ORCA
这里有几个基本操作的视频演示http://bbs.keinsci.com/thread-13956-1-1.html，但不涉及过渡态搜索

以下是个过渡态搜索例子。里面的结构是HCN->CNH异构化的过渡态初猜
! B3LYP/G 6-31G** optTS freq tightSCF noautostart miniprint nopop
%maxcore 1000
%pal nprocs  4 end
%geom Calc_Hess true end
* xyz 0 1
C    0.56314246 -0.57635434 0.00000000
N    -0.37519999 0.35694724 0.00000000
H    -0.79524238 -1.09345422 0.00000000
*

只能帮你到这了，其它的需结合视频、手册、本论坛里ORCA板块的相关帖子举一反三。
可视化程序如果不能用收费的话，只能用VMD或者avogadro看结构

作者
Author: Synthesis 时间: 2019-8-13 08:19

sobereva 发表于 2019-8-13 06:51
对于你的情况，免费程序里能用的也就ORCA
这里有几个基本操作的视频演示http://bbs.keinsci.com/thread-13 ...

谢谢。想问一下，gaussian9有免费的吗？有学长说是弄到了，用这个做的

作者
Author: Graphite 时间: 2019-8-13 08:27
本帖最后由 Graphite 于 2019-8-13 08:36 编辑

汗颜，同学你这高中是真的厉害。
让我想起我N年前化竞的时候，看到参加国集的同学在玩高斯，看了几眼觉得挺好玩儿，后来又因缘际会，误打误撞进了这个行当。作为过来人，忝言两句：参加竞赛固然兴趣是出发点，但毕竟也是为了好点前程参加的应试。有兴趣看看玩玩当然好，别牵扯太多精力，以后进本科、读研，知识、技术慢慢都会有的。

作者
Author: naoki 时间: 2019-8-13 09:07

Synthesis 发表于 2019-8-13 08:19
谢谢。想问一下，gaussian9有免费的吗？有学长说是弄到了，用这个做的

GS是需要购买的商业化软件，不过网上有安装包，仅供学习参考使用，没买版权的话不能用于学术发表。

作者
Author: Shine剪水 时间: 2019-8-13 09:12
@asasas ，可以考虑鼓励学生参加化竞呀！

作者
Author: 卡开发发 时间: 2019-8-13 09:25
我觉得可以尝试对就近的一些大学中做这方面的老师发邮件试试看，同一城市面对面交流会方便一些。如果有人愿意提供帮助的话，一个是可以有人提供指导，再就是软件版权方面也能解决。就你的需求而言我个人觉得还是Gaussian是最好的选择，算法方面较为稳健可靠，也有现成的图形界面作为跳板；导师需要把关方法选择和结果分析方面的以及对结构化学方面的知识和相应的一些简单的计算机知识做一些引导。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2019-8-13 10:29
本帖最后由 zjxitcc 于 2019-8-13 10:32 编辑

我比较好奇。。只是给中学老师答辩，应该不用管软件版权问题吧···知道的就那么几个人。拿没版权的高斯算也没人会说啊，又不是正式发表论文，自己小范围做做课后作业而已。
推荐我参与的微信公众号里的高斯教程：https://mp.weixin.qq.com/s/jQgbNQf4w2-8Xmdl5hWy1Q

作者
Author: yygong 时间: 2019-8-13 10:38
你应该报名参加这几天的北京科音初级量子化学培训班的

作者
Author: Synthesis 时间: 2019-8-13 12:48

卡开发发发表于 2019-8-13 09:25
我觉得可以尝试对就近的一些大学中做这方面的老师发邮件试试看，同一城市面对面交流会方便一些。如果有人愿 ...

那请问您有免费高斯安装包或网址吗？我想先弄个免费的玩玩看，用得起来再决定要不要找人弄版权

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-13 23:44

Synthesis 发表于 2019-8-13 12:48
那请问您有免费高斯安装包或网址吗？我想先弄个免费的玩玩看，用得起来再决定要不要找人弄版权

别在论坛公开求收费程序

作者
Author: DoorBell 时间: 2019-8-16 12:28

Synthesis 发表于 2019-8-13 12:48
那请问您有免费高斯安装包或网址吗？我想先弄个免费的玩玩看，用得起来再决定要不要找人弄版权

Gaussian是商业程序而且是不接受个人购买的。

免费软件推荐ORCA，可以到官网上下载（需要注册一个账号）。ORCA官网：https://orcaforum.kofo.mpg.de/。不过下载速度可能很慢。百度云的链接在论坛里有。

作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2019-8-23 21:53
Gaussian是商业程序，不可能免费。在网络上的公开论坛里向别人求商业程序，别人会很为难的。
我本科时听结构化学课的老师提起过，以前确实有一个参加化学竞赛的同学找那位老师学习。那个高中生当时用的就是那个老师课题组里的Gaussian。我读研时也见过有高中生来课题组里做summer research的。反正这种情况，一般都是课题组的导师让一个研究生指导高中生做一个很简单的题目就行了。
玩玩总是可以的，但如果只是玩玩，却没有相应的知识储备的话，也很容易忘记。反正高中生又没到考虑将来的具体的研究方向的时候，有时间并且有兴趣的话，多接触接触也行。我的一个本科同学的例子比较有意思，他参加化竞时成绩优异，保送到了心仪的学校的化学系。他跟绝大多数学生一样，上大学之前没有接触过计算化学。他上大学之后，比较厌恶教科书里的一些似是而非的解释，然后他就在大二时加入了一个主要做应用性的计算的课题组。后来又保研到另一个学校的偏理论的组里写代码。
你如果真的想让自己的实验数据跟计算的数据吻合得比较好的话，有点挑战性。我记得自己本科的时候，物化实验课上，大家做得数据最烂的，都是测反应速率常数的实验。本科生头一次做都容易搞砸的实验，不建议高中生做。高中生又测反应速率常数又计算能垒，我觉得有点吃力不讨好。你如果挑一个不涉及化学动力学的题目，比如，氧弹法测几个物质的燃烧热（如果有相应的条件的话），然后自己算算相应的燃烧热，也许还更容易一些。

作者
Author: qazwer 时间: 2019-8-31 17:07
竞赛过来人提醒你，如果想拿省一，国奖金牌什么的。一定要找对方向，这个时间学量化计算，不如多刷几套胡波题，考个好大学再搞不迟。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)