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标题: Amber二面角力场参数意义求助 [打印本页]

作者
Author: hamtaro 时间: 2019-8-19 10:04
标题: Amber二面角力场参数意义求助
gaff2.dat 文件中，在dihedral的部分，有一列显示参数的意义是Vterm，请问这里的Vterm指的是什么呢？他在计算当中起的作用又是什么呢？
文件里面的Vterm有3，2，1，-3，-2，-1这些数值，可在自己添加参数的时候应该如何设置这些数值呢？

aa-bb-cc-dd 4 2.000       0.000 2 set2-17 SS AUE=0.8458 RMSE=1.0943 TorType=3
|          | |          |    |    | |          | |       |
atom-type | force-constant| Vterm | Opt-methods | | Torsional-Type
         multiplicity    phase model-cmpd       Prediction-Error

抱歉因为查了很久都没有找到很确切的解释，只看到一个回答：“The negative in front of the 3 indicates that this is
NOT the last term for the dihedral, so it keeps reading terms until it finds one with a positive value of the peridiocity. That's the next line."

不知道是否可以给出一个更加明确的解释？感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-19 11:02
Amber力场二面角参数的解释
http://sobereva.com/1

作者
Author: hamtaro 时间: 2019-8-19 11:24
谢谢sob老师！

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