计算化学公社

标题: 分子大小和分子内径的大小怎么算? [打印本页]

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心辉    时间: 2019-8-20 20:17
标题: 分子大小和分子内径的大小怎么算?
请问各位老师,在算高斯的时候有个同学问我,如果给定一个分子结构,这个结构在空间的长宽高是是多少怎么测量呢?
比如说一个苯分子,长度宽度和厚度各是多少,或者是画出来的一个冠醚内径是多少,这些要怎么算和求?

作者
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captain    时间: 2019-8-20 20:41
本帖最后由 captain 于 2019-8-20 20:46 编辑

谈谈分子半径的计算和分子形状的描述   http://sobereva.com/190
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴  http://sobereva.com/426
使用Multiwfn计算分子的动力学直径   http://sobereva.com/503


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Shine剪水    时间: 2019-8-20 21:42
对于内径大小的测量,如果分子的对称性比较好的话,可以取晶体结构或者建模优化后,选合适的原子测量距离,然后结合captain老师给的链接里面的思路进行测量。
作者
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心辉    时间: 2019-8-21 10:38
captain 发表于 2019-8-20 20:41
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述   http://sobereva.com/190
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分 ...

谢谢
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心辉    时间: 2019-8-21 10:38
Shine剪水 发表于 2019-8-20 21:42
对于内径大小的测量,如果分子的对称性比较好的话,可以取晶体结构或者建模优化后,选合适的原子测量距离, ...

谢谢




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