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标题: 求助：Gromacs安装cmake一直报错找不到文件 [打印本页]

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Author: a617788816 时间: 2019-8-21 23:36
标题: 求助：Gromacs安装cmake一直报错找不到文件
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-26 16:40 编辑

我是Gromacs初学者，在安装Gromacs的时候cmake一直报错，源目录找不到文件，不知道如何解决，已经先安装了fftw3.3.8，gromacs是2019.3的版本，请各位大神帮忙解答

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-22 00:17
严格照着这个装，文中的命令有空格的地方不能省，看清楚空格
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

作者
Author: 少年爱吃地三鲜 时间: 2019-8-22 08:03
你可以 whereis cmake 先找一下系统里有没有cmake 有的话再加到环境变量里就行了。

作者
Author: a617788816 时间: 2019-8-22 10:14
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-22 10:19 编辑

sobereva 发表于 2019-8-22 00:17
严格照着这个装，文中的命令有空格的地方不能省，看清楚空格
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http: ...

我按照您之前的帖子 http://bbs.keinsci.com/thread-43-1-1.html
安装cmake，因为我的版本查看了是2.8的，但是显示安装没成功，不知道是什么问题, 因为我是user用户安装，就用了您之前的方法
图片我添加了，请sob老师帮我看一下

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-22 11:45

a617788816 发表于 2019-8-22 10:14
我按照您之前的帖子 http://bbs.keinsci.com/thread-43-1-1.html
安装cmake，因为我的版本查看了是2.8的 ...

找管理员要个root密码装公共目录下，要么编译cmake在make install前指定成安装在自己的私有路径下

作者
Author: a617788816 时间: 2019-8-22 13:10
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-22 17:25 编辑

sobereva 发表于 2019-8-22 11:45
找管理员要个root密码装公共目录下，要么编译cmake在make install前指定成安装在自己的私有路径下

请问这个代码要怎么打呢？在make install前面要怎么加？

作者
Author: a617788816 时间: 2019-8-23 10:28

sobereva 发表于 2019-8-22 11:45
找管理员要个root密码装公共目录下，要么编译cmake在make install前指定成安装在自己的私有路径下

sob老师，安装cmake在自己的指定路径的代码要怎么打啊？能指导一下吗

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-23 14:55

a617788816 发表于 2019-8-23 10:28
sob老师，安装cmake在自己的指定路径的代码要怎么打啊？能指导一下吗

GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

此文第1节里已增加cmake编译和指定安装路径的方法

作者
Author: a617788816 时间: 2019-8-23 21:20
本帖最后由 a617788816 于 2019-8-24 18:26 编辑

sobereva 发表于 2019-8-23 14:55
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821- ...

sob老师，在安装CUDA toolkit的过程中出现报错，安装过程完全按照官网上的指令，图片如上，不知道是不是我选的下载类型有问题，帖子中未提到下载哪个，所以我自己选择了rpm network，sob老师您帮忙看看是什么原因报错

作者
Author: a617788816 时间: 2019-8-26 16:42

sobereva 发表于 2019-8-23 14:55
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821- ...

sob老师，我在安装Gromacs的过程中没有报错，用的是MPI和AVI_256，也填写了source，但是最后出来看GMX版本却显示没这个命令，这是怎么回事？装没装进去？情况如上图

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-27 00:42
装OpenMPI干嘛，难道要跨节点？
连安装视频都录了，没法说得更清楚了

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