计算化学公社
标题:
求助20条链修改PDB文件的问题
[打印本页]
作者Author:
少年爱吃地三鲜
时间:
2019-8-23 20:28
标题:
求助20条链修改PDB文件的问题
老师好,我的体系中有20条相同结构的聚合物链,现在想,如何简单的修改PDB文件满足gromacs中使用,以前是从头到尾的修改,每一个残基,每一条链都修改,现在想,因为每条链都是相同的结构,我的初步想法是先修改一条链的PDB文件满足gromacs要求,然后再得到的top文件,再修改其中的 【system】下将分子数改为20 如图
[ system ]
; Name
Protein
[ molecules ]
; Compound #mols
PS_chain_P 20
将完整体系的20条链都 改成单独一条链的 残基序号和链标识符, 如果这个方法麻烦 请问还有更简单的方法吗?
作者Author:
sobereva
时间:
2019-8-23 22:16
就应该这么做
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3