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标题: 请问计算蛋白质和水环境中底物的pka的方法 [打印本页]

作者
Author: 阿怪- 时间: 2019-8-30 20:20
标题: 请问计算蛋白质和水环境中底物的pka的方法
我的底物有三个环己烷还连着辅酶A，是一个比较大的分子，已经加完水做完平衡了，想请教各位老师计算底物在周围蛋白和水环境下的pka的方法

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-30 20:54
要求不高的情况直接用PROPKA 3.1，蛋白质残基和配体的pka都会给你，但是这样的结果很粗略。

严格的话需要做TI/FEP之类的计算，很麻烦

作者
Author: 阿怪- 时间: 2019-8-31 16:29

sobereva 发表于 2019-8-30 20:54
要求不高的情况直接用PROPKA 3.1，蛋白质残基和配体的pka都会给你，但是这样的结果很粗略。

严格的话需 ...

谢谢sob老师

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