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标题: 多肽抑制TasA淀粉样蛋白自组装,该进行哪方面的计算? [打印本页]

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hddonghao    时间: 2019-9-9 16:57
标题: 多肽抑制TasA淀粉样蛋白自组装,该进行哪方面的计算?
本人小白一个,打算做多肽抑制剂在TasA淀粉样蛋白自组装上的抑制,TasA是一个大蛋白,含有210个氨基酸,现报道了其单体下的PDB结构,但仍无纤维结构的报道。TasA是一个非典型的淀粉样蛋白(无典型淀粉样蛋白的重复序列,如Ab,Amylin等),加之无纤维结构进行报道,因此,无法用伞形抽样的方法来研究。现只能考虑到做多肽和单体TasA的亲和研究,研究其结合位点,如果想探究TasA组装规律,以及多肽在其组装中的作用,利用GMX分子动力学,可以做哪些方面的研究呢?求指教。





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