计算化学公社

标题: 用VMDrender_full进行渲染求助 [打印本页]

作者
Author: 土拔鼠 时间: 2019-9-11 13:27
标题: 用VMDrender_full进行渲染求助
各位老师我用gmx_spatial 生成了.cube文件按照博文的操作用VMD进行渲染在VMD render之后双击 VMDrender_full.bat 页面一直卡在下图所示的47% 试了两次都是这样请问这可能是哪里有问题我去修改一下本来想上传cube文件但有300多M 传不上来实在抱歉

还有想问一下用gmx_spatial 生成的.cube在VMD里显示为什么不是很光滑见图2 我是用100nsMD输出的.xtc进行生成的谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2019-9-11 23:28
把-fullshade去掉再试，否则可能耗时过高看起来像卡住
也可以尝试把vmd脚本里set mater Glossy去掉而用默认的Opaque

不光滑是因为采样不充分，或者计算方式有问题，或者等值面设置不合理

最好手动在VMD里操作显示等值面，反复调节isovalue找到最合适的

作者
Author: 土拔鼠 时间: 2019-9-11 23:43

sobereva 发表于 2019-9-11 23:28
把-fullshade去掉再试，否则可能耗时过高看起来像卡住
也可以尝试把vmd脚本里set mater Glossy去掉而用默 ...

谢谢卢老师

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