计算化学公社

标题: NBO5计算电子自旋布局为负值 [打印本页]

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Author: xiaobogaga 时间: 2019-9-13 09:03
标题: NBO5计算电子自旋布局为负值
大家好，最近在用NBO5计算一个complex 弱相互作用的体系时，计算的自然电子密度产生负值（最后一列），请问是什么原因造成的呢？用Multiwfn+VMD作图后，取0.01等值面，如图2。 (, 下载次数 Times of downloads: 67) (, 下载次数 Times of downloads: 71)

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Author: granvia 时间: 2019-9-13 11:19
自旋密度为-1表示有个beta单电子嘛

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Author: sobereva 时间: 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了，什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353（http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html）

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Author: xiaobogaga 时间: 2019-9-13 13:45

sobereva 发表于 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了，什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘 ...

谢谢sob老师

作者
Author: ljh123 时间: 2025-2-3 02:44

sobereva 发表于 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了，什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘 ...

sob老师，我想请问下一种情况：金属离子和有机物的配位键发生均裂，形成有机自由基和低价态金属离子，自旋多重度均为5。那此时这个有机自由基的自旋多重度应该是-1还是1呢。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-3 04:34

ljh123 发表于 2025-2-3 02:44
sob老师，我想请问下一种情况：金属离子和有机物的配位键发生均裂，形成有机自由基和低价态金属离子，自 ...

“均为5”不知道你指什么
自旋多重度只能为>=1的整数
拿不准基态自旋多重度是什么就对比不同自旋态的能量

作者
Author: ljh123 时间: 2025-2-3 22:45

sobereva 发表于 2025-2-3 04:34
“均为5”不知道你指什么
自旋多重度只能为>=1的整数
拿不准基态自旋多重度是什么就对比不同自旋态的能 ...

sob老师我表达的有问题十分不好意思，我的意思就是配位键均裂前和均裂后体系的总自旋多重都都是5。反应物状态时，金属离子和有机物形成配位键，金属离子有4个未成对电子，有机物没有未成对电子。此时配位键发生均裂后，若有机物带有一个未成对电子，也就是失一个电子形成自由基时，该有机自由基总的自旋布居应该是1还是-1呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-4 14:48

ljh123 发表于 2025-2-3 22:45
sob老师我表达的有问题十分不好意思，我的意思就是配位键均裂前和均裂后体系的总自旋多重都都是5。反应物 ...

1还是-1都一样，本来片段就是单独计算的，1和-1能量都是相同的

作者
Author: ljh123 时间: 2025-2-6 14:57

sobereva 发表于 2025-2-4 14:48
1还是-1都一样，本来片段就是单独计算的，1和-1能量都是相同的

感谢sob老师解答。但是如果我想把产物放在一起算的话，我设置自旋多重度应该是5（对应有机自由基自旋布居为-1，金属离子自旋布居为5）还是7呢（对应有机自由基自旋布居为+1，金属离子自旋布居为5）。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-6 17:45

ljh123 发表于 2025-2-6 14:57
感谢sob老师解答。但是如果我想把产物放在一起算的话，我设置自旋多重度应该是5（对应有机自由基自旋布居 ...

都已经均裂了，意味着没有相互作用了，毫无理由再一起算

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Author: ljh123 时间: 2025-2-6 20:01

sobereva 发表于 2025-2-6 17:45
都已经均裂了，意味着没有相互作用了，毫无理由再一起算

sob老师，因为这个过程我是在显式水模型下用AIMD得到的，由于该反应涉及水溶剂的质子转移过程，因此常规DFT考虑隐式溶剂模型的情况下我找不到过渡态以及产物。因此我得到的产物也是一起存在于显式水分子中的。所以可能不太适合分开算。
我对该过程的各个帧计算了自旋布局，发现键均裂后，有些帧的有机物自旋布居接近1，有些帧则接近-1。该过程的总自旋多重度一直为5。这就导致我不太清楚我在计算产物时，因该用自旋布居接近1的帧还是-1的帧

作者
Author: sobereva 时间: 2025-2-7 04:44

ljh123 发表于 2025-2-6 20:01
sob老师，因为这个过程我是在显式水模型下用AIMD得到的，由于该反应涉及水溶剂的质子转移过程，因此常规D ...

对于片段已经充分分离的轨迹部分，倘若相邻的帧出现了1和-1的突变，正说明本质上此时1和-1的能量是简并的，没必要区分

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